医药学医学毕业论文 应用seldi-tof-ms技术建立肝细胞癌病人血清蛋白质指纹图谱筛选模型

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1、湖南师范大学本科毕业论文考籍号:XXXXXXXXX姓名:XXX专业:医药学医学论文题目:应用SELDI-TOF-MS技术建立肝细胞癌病人血清蛋白质指纹图谱筛选模型指导老师:XXX二〇一一年十二月十日作者:闫志勇刘华丁守怡宋旭霞钱冬萌田字彬王斌【关键词】肝肿瘤;肽谱;蛋白质工程  [摘要]目的研究肝细胞癌(HCC)病人、乙型肝炎病毒(HBV)携带者、健康人血清蛋白质表达的差异,以建立HCC血清蛋白质指纹图谱筛选模型。方法用表面加强激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)获得HCC病人、HBV携带者及健康人血清中的蛋白质指纹图谱,用计算机软件比较分析,并建立

2、HCC的血清蛋白质指纹图谱模型筛选模型。结果HCC组与非肿瘤组共有11种蛋白质有显著性差异;以其中4种蛋白质生物标志物(相对分子质量3448、6883、4467和3134)组建的筛选模型检测灵敏度为94.6%,特异度为92.3%。结论建立的血清蛋白质指纹图谱模型能够区分HBV携带者与HCC病人,SELDI-TOF-MS在HCC的诊断及肿瘤特异性蛋白质生物标志分子的筛选等方面具有一定价值。  [关键词]肝肿瘤;肽谱;蛋白质工程  [ABSTRACT]ObjectiveToestablishaserumproteomicpatternandstudythedifferenc

3、esofserumproteinspectraofpa-tientswithhepatocellularcarcinoma(HCC),ofHBVcarriersandofhealthycontrols.MethodsProteomicspectraofHCCandageandsex-matchednon-HCCcontrols,includingHBsAgcarriersandhealthypeoples,weregeneratedbysurface-enhancedlaserdesorption/ionizationtime-of-flightmassspectrom

4、etry(SELDI-TOF-MS)onWCX-2chips.Ciphergensoftwarewasusedtoidenti-fyproteomicfeatures,andBiomakerWizardsoftwaretodetectthedifferencesinproteinpeaksbetweenHCCandnon-HCCcon-trols,andthentosetupaserumbiomarkerpatterntoscreentheHCC.ResultsElevenproteinsweresignificantlydifferentbe-tweenHCCandn

5、on-HCCcontrols,amongwhich,four(m/z3448、6883、4467and3134)wereselectedtosetupaoptimalserumbiomarkerpattern.Thisproteomicpatternyieldedahighsensitivity(94.6%)andspecificity(92.3%).ConclusionTheestab-lishedserumproteomicpatterncandistinguishtheHCCcasesfromnon-HCCones,andtheproteomicsapproach

6、ofSELDI-TOF-MScangreatlyfacilitatethediscoveryofnewtumorbiomarkers.  [KEYWORDS]liverneoplasm;peptidemapping;proteinengineering  原发性肝细胞癌(HCC)是我国常见的恶性肿瘤,居癌症死因第2位,造成其高病死率的主要原因是目前尚缺乏特异性高的早期诊断方法,由于HCC病人早期常无症状,发现时已属中、晚期,丧失了治疗的最佳时机[1]。HCC的发生是一个多因素诱导、多基因突变的漫长的多阶段过程,其中乙型肝炎病毒(HBV)的感染在HCC发生过程中具有重要作

7、用。研究发现,90%的HCC与HBV感染有关[2]。任何疾病在出现病理变化之前,细胞内的蛋白质在成分和数量上都会有相应改变,并通过血清中的蛋白质模式反映出来。因此,通过比较不同疾病人群血清中差异蛋白质的表达,可能筛选出肿瘤相关的标志分子。最近几年出现的表面加强激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)是蛋白质组学研究中重要的工具,已开始应用于肿瘤早期诊断的生物标志物的筛选[3~8]。本研究利用该技术比较了HCC病人、HBsAg携带者及健康人血清蛋白质表达的差异,对建立HCC血清蛋白质指纹图谱筛选模型进行了初步探讨。  1资料

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