中医临床研究方法的思考与实践——系统生物学湿干研究模式与中医临床研究

中医临床研究方法的思考与实践——系统生物学湿干研究模式与中医临床研究

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1、中医临床研究方法的思考与实践——系统生物学湿干研究模式与中医临床研究世界科学技术一中医药现代化★科技论坛摘要:海量生物信息获取和计算机技术的发展使得系统生物学的湿干研究模式成为可能,干性的计算机模拟和模型研究一般基于海量的生物学实验数据如基因组,蛋白质组和代谢组的湿性研究,希望能获得高于每一单一数据的生物学知识和系统模型,并能指导新的实验研究.从而形成循环上升的计算机模拟和实验相结合的系统生物学湿干研究模式,大大提升了系统生物学研究生物复杂巨系统的能力和效率.一直以来,传统中医药学的研究以临床诊疗实践为核心,对临床诊疗经验的总结,归纳,提升和再运用,形成了中医药理论发展和研究

2、的主要成功模式.如何利用现代信息和计算机科学技术,依据海量临床信息,在计算机辅助下进行基于数据的干性模拟研究,革命性的提升传统中医学"从临床中来"再回"到临床中去"的能力和效率,这是关乎中医药学发展的重大科技问题.本文对中医临床湿干研究模式的思路进行了探讨,提出基于数字化手段的中医临床科研一体化体系,并着重分析实现中医临床科研一体化的湿干研究模式技术框架和初步研究实践.关键词:中医临床研究湿干研究模式系统生物学系统生物学m作为21世纪生命科学领域的一门新兴学科,被生物学家认为是当今医学和生物学的核心驱动力.在系统水平上理解生命系统需要从系统的结构,系统动力学,控制方法和设计方

3、法等方面进行收稿日期:2007-01-05修回日期:2007-01—11研究.干性计算机模拟,模型分析和湿性的实验室内研究相结合,以科学假设和海量数据为驱动,从系统层次综合研究多种系统组分及其关系是系统生物学研究的主要特点.以初步湿性实验室研究启动的湿干性迭代研究,不断优化理论模型的过程成为系统生物学研究方法区别于分子生物学的关键.第291次香山科学会议报告.北京市科委重大计划项目(H020920010031):中医药防治重大疾病个体诊疗评价体系得研究,负责人:刘保延;国家973项目(2006CB504600)中医辨证论治疗效评价方法基础理论研究,负责人:刘保延;国家博士后科

4、学基金项目(2005037106),负责人:周雪忠.联系人刘保延,本刊编委,主任医师,国务院政府特殊津贴专家,中国中医科学院副院长,主要研究方向:中医临床研究方法;Tel:010.64014411.E-mail:liuby@mail.cintem.ac.cn.[WorldScienceandTechnology~ModernizationofTraditionalChineseMedicineandMateriaMedica]852007第九卷第一期★Vo1.9No.1中医药学面对人体复杂巨系统,建立了一整套从人体功能状态变化规律来掌握,调控人体生命活动的方法学,从整体,动态

5、,个体化的层次,把握人体的变化规律,形成了自己独特的发展道路,开创了人类掌握复杂巨系统的先河.但由于中医药学目前所使用的技术手段与中医药学的理念和方法学不相适应,大大制约了中医药优势的发挥.借鉴系统生物学干湿研究方法,结合中医药学临床诊疗的实践,通过临床科研一体化的技术平台,建立"以数据(事实)为导向,以假设为驱动,借助模型模拟研究,提升中医传统的"从临床中来,到临床中去"研究方法的效率和能力,促进中医药跨越式发展,是本文讨论的主要内容.一,系统生物学中的湿干研究模式"在过去的5O多年内,实验生命科学的主要目标是寻找特定的基因或蛋白质,从而在分子水平上根据个别的基因或蛋白质行

6、为来解释生命活动.随着生命科学的进步和后基因组时代的到来,人们逐渐认识到,过去得到的图景过于简单,生命实际上是一个由成千上万种基因,蛋白质和其他化学分子相互作用构成的复杂系统;对于高等生物而言,除了分子层面的复杂行为外,还有着细胞,组织和器官等不同层面的复杂活动;生命现象是这样一种复杂系统的整体行为".正是在这一认识的基础上系统生物学诞生了."系统生物学是研究一个生物系统中所有组成成分(基因,mRNA,蛋白质等)的构成,以及在特定条件下这些组分间的相互关系的学科.也就是说,系统生物学不同于以往的实验生物学一仅关心个别的基因和蛋白质,它要研究所有的基因,所有的蛋白质,组分间的所

7、有相互关系.显然,系统生物学是以整体性研究为特征的一种大科学."正由于此,系统生物学的研究采取了"湿"的实验部分(实验室内的研究)和"干"的实验部分(计算机模拟和理论分析)的整合.她首先要选择一种条件(干涉),然后利用"发现的科学"的方法,对系统在该条件下的所有元素进行测定,得到海量的实验数据(湿性研究);以数据(事实)为导向,借助计算机模拟和理论分析(干性研究)提出假设,预测系统的发展,指导实验研究的设计,然后再利用"发现的科学"研究手段进行新研究.这两种不同研究策略和方法的互动和整合,为系统生物学的

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