2015-2016年湖南省手足口病cv-a6型肠道病毒vp1区基因特征及病毒亚型分析

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1、2015-2016年湖南省手足口病CV-A6型肠道病毒VP1区基因特征及病毒亚型分析黄烕胨嵐蔡亮雙愷^张帆厘她锋张红湖南省疾病预防控制中心湖南:生物分子学重点实验室目的了解湖南省2015-2016年引起手足口病的CV-A6型肠道病毒病原学特征，为手足门病科学防控提供依据。方法对2015-2016年湖南省手足门病哨点医院和地市级疾控中心上送的其他肠道病毒阳性标本进行CV-A6核酸检测，选择有代表性的标本进行CV-A6VP1区全长序列扩增和测序。运用Seqman和MEGA5.2软件对获取序列与从GenBank下载的CV-A6VP1区全长序列进行遗传进化分析。结果共对281份非EV-

2、A71和非CV-A16肠道病毒阳性标本进行了CV-A6核酸检测，142份标本检测结果为CV-A6阳性，阳性率为50.53%,对不同地区和不同年份的有代表性的69份标本进行VP1区全长序列测定，60份测序成功，病毒型别均为CV-A6的D1亚型。结论湖南省存在引起手足口病的非EV-A71和非CV-A16的CV-A6肠道病毒感染，其基因型别为D1亚型，与我国其他地IX流行的病毒亚型基本一致。关键词：CV-A6;手足口病;基因型别;VP1区;黄威(1966-),女，副主任技师，主耍从事肠道病毒的实验室检测工作。作者，E-mail:931525821@qq.com。2017-05-16基

3、金：湖南省卫计委科研项目(C2016032)VP1geneticcharacteristicsandsubgenotypeofcoxsackievirusA6associatedwithhand,footandmouthdiseaseinHunanProvince,2015-2016HUANGWeiCHENYuCAILiangLUOKai-weiZHANGFanZHOUShuai-fengZHANGHongKeyLaboratoryofMicrobialMolecularBiologyofHunanProvince，HunanProvincialCenterforDisease

4、ControlandPrevention;Abstract：ObjectiveToinvestigatethepathogenicfeaturesofcoxsackievirusA6(CV-A6)associatedwithhand,footandmouthdisease(HFMD)inHunanProvinceduring2015-2016soastoprovideabasisforscientificpreventionandcontrolofHFMD.MethodsThepositivespecimensofotherenterovirusessentbyHFMDsent

5、inelhospitalsandprefecture-levelCDCsinHunanProvinceduring2015-2016werecollectedtoperformCV-A6nucleicaciddetection.CV-A6real-timePCRpositivespecimenswerethensubjectedtoRT-PCRforfulllengthsequenceamplificationandsequencingofVP1region.Thephylogeneticanalysiswasperformedtoanalyzethefull-lengthge

6、nesequencesencodingVP1ofCVA6isolatesandsequencesdownloadedfromGenBankbyusingSeqmanandMEGA5.2softwarepackages.ResultsAtotalof281non-EV-A71andnon-CV-A16enteroviruspositivespecimensweredetectedbyCV-A6real-timePCRassay.142specimenswerepositiveforCV-A6，withthepositiveratebeing50.53%.69specimensfr

7、omdifferentregionsanddifferentyearswereselectedfordeterminingthefulllengthsequenceofVP1regionand60weresuccessfullydetermined.ItwasfoundthatallsequencesdetectedbelongedtoCV-A6subtypeDcluster1.ConclusionsTherearenon-EV~A71andnon-CV-A16enterovirusinfe