邯郸市2009~2011年手足口病流行特征及肠道病毒71型vp1区基因特征分析

邯郸市2009~2011年手足口病流行特征及肠道病毒71型vp1区基因特征分析

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1、河北医科大学硕士学位论文邯郸市2009~2011年手足口病流行特征及肠道病毒71型VP1区基因特征分析姓名:李建坡申请学位级别:硕士专业:流行病与卫生统计学指导教师:朱会宾201203中文摘要邯郸市2009-2011年手足口病流行特征及肠道病毒7l型VPI区基因特征分析摘要目的;1通过对邯郸市2009-2011年手足I:I病(HFMD)的流行病学特征的分析,明确HFMD的流行规律,为HFMD的预防控制措施和策略的制定提供科学依据。2明确邯郸市2009-2011年EV71流行株的基因型别及其与其他地区EV71流行株的关系,探索其基因型的遗传变异情况。方法:l

2、通过中国疾病监测信息系统,收集2009~2011年邯郸市报告的HFMD病例信息,通过SPSSl3.0分析比较三年中HFMD病例的三间分布。2采集HFMD病例的临床标本,针对肠道病毒(EV)5’端非编码区保守基因序列以及EV71VPl区基因序列设计EV通用引物、EV71型和CoxAl6型特异引物,.进行荧光定量PCR检测。3将检测为EV71阳性的HFMD实验室诊断病例标本分年度按采集时间编号,随机抽取接种RD细胞进行病毒分离培养。4设计并合成针对EV71型VPl基因片段的引物,对经检测EV71核酸阳性的培养物进行RT-PCR扩增,并测定其序列,用DNASTA

3、R软件进行核苷酸和氨基酸序列同源性分析,构建系统进化树,对邯郸市2009,-,2011年EV7l流行株基因亚型进行分析。结果:1流行强度。2009~2011年邯郸市HFMD发病率为218.01/10万、122.54/10万,和34.90/10万呈连续下降趋势。2时间分布。2009年HFMD疫情发生时间早且上升快,来势猛,下降快,无拖尾;2010年HFMD疫情上升比2009年延后两周,疫情上升趋势缓慢,达高峰后,与2009年流行曲线重合略低,下降缓慢,32周后高于2009年同期水平,有明显的拖尾现象;2011年有两个发病高峰,一个在春末夏初,与前两年高峰基本

4、一致,另一个出现在冬季,有冬季小高峰或翘尾现象。中文摘要3地区分布2009~2011年邯郸市19个县市、区)均有病例报告,但发病率区域间差异很大,且高发和低发县区相对固定。三年中发病率均较低的县区有峰峰矿区、邱县和魏县,发病率均较高的是邯山区、邯郸县和曲周县。4人群分布2009~2011年邯郸市HFMD男女性别比例在1.67~1.73之间,男性病例多于女性病例(P

5、中的趋势;散居儿童发病构成呈上升趋势,而幼托儿童和学生里下降趋势。5病原学检测结果2009--,2011年共检测1267例HFMD标本,阳性896例,阳性率为70.72%。阳性标本中,EV71、CoxAl6和其他肠道病毒的构成分别为65.51%、15.63%和18.86%。EV71、CoxAl6和其它肠道病毒在各年的构成比例不一致(X2=106.063,P<0.00I),但均以EV71为主。6EV71的VPl区基因特征分析邯郸市13株EV7l代表株之间VPl区核苷酸同源性在96.4%-,-100%之间,与台湾分离株VPl区同源性为92.4%-93.2%,与

6、2008年阜阳、2009年河南、2010年河北、2010年云南和2011年陕西分离的EV71代表株核苷酸同源性在96.6%-099.1%之间,与A、B基因型代表株VPI区同源性差异较大,在82.0%~82.7%与83.6%-84.5%之间。已知基因型C1、C2、C3、C4代表株的同源性分别在89.8%-.90.3%、89.3%-90.O%、87.9%---88.7%和96.0%-96.9%之间。基于VPl区构建的EV71系统进化树显示,这13株邯郸市分离到的EV71毒株均为C4a亚型。结论:1邯郸市2008-2010年连续三年HFMD呈高流行状态,2009

7、年为发病高峰年,2011年转入低流行状态。HFMD发病具有区域特征。2不同年份HFMD流行曲线有所不同,2009年和2010年春夏高峰明显。2009年HFMD疫情上升迅猛,下降快,无拖尾现象;2010年疫情上升平缓,下降缓慢,有拖尾现象;2011年呈现两个发病小高峰,一个在春末夏初,一个在冬季。中文摘要3HFMD发病男性儿童高于女性儿童,以3岁以下散居儿童为主,发病年龄近年有向低年龄集中的趋势。4邯郸市2009---2011年HFMD的病原谱构成不同,CoxAl6和EV71及其它型别致HFMD肠道病毒交替变化,但仍主要以EV71为主。5EV71毒株VPl基

8、因分型及系统进化树分析表明,邯郸市2009---2011年EV71

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