方差分析与回归分析R软件内置函数.doc

方差分析与回归分析R软件内置函数.doc

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1、方差分析与回归分析R软件内置函数一、方差分析1.单因素方差分析aggregate(指标,by=list(分组指标),FUN=函数)-----分组计算有关量aov(模型,data=文件,projections=FALSE,qr=TRUE,contrasts=NULL,...)---方差分析summary()----显示方差分析结果model.tables(模型名,"效应或均值",se=T或F)--TablesofResultsfromanAovModelFitkruskal.test(模型,data=

2、文件)----Kruskal-WallisRankSumTest2.多重比较pairwise.t.test(x,g,p.adjust.method=p.adjust.methods,pool.sd=!paired,paired=FALSE,alternative=c("two.sided","less","greater"),...)---Pairwisettests其中p.adjust.methods有Bonferroni"bonferroni"Holm(1979)"holm"Hochberg(1

3、988)"hochberg"Hommel(1988)"hommel"Benjamini&Hochberg(1995)"BH"Benjamini&Yekutieli(2001)"BY"TukeyHSD()----TukeyHonestSignificantDifferences3.二因素方差分析aov(指标~factor+factor2,data=文件)-----不考虑交互作用方差分析aov(指标~factor+factor2+factor1*factor2,data=文件)-----考虑交互作用方差

4、分析二、相关分析与回归分析1.相关分析Cor(指标1,指标2,method=)---计算相关系数Cor.test(指标1,指标2,method="",alternative="",conf.level=)---相关系数检验其中methodpearson,kendall,spearman2.回归分析lm(模型,data=)----拟合线性模型summary()---输出拟合线性模型有关参数plot()----作散点图abline()画拟合回归线于散点图上predict(模型,预测点,interval=

5、"prediction",level=0.95)----作预测

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