玉米—大刍草渐渗系的表型统计及SNP分子标记开发.pdf

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1、Classifiedlndex：S513U．D．C：633。1SouthwestUniversityofSc’enceandTechnoCIenCeIecl3n01IogyMasterDegreeThesiSPhenotypiCStatistiCSofIntrogresiveGroupofMaize一一TeosinteandDeveIopmentofSNPMarkerforMa；zeandTeosinteGrade：Candidate：AcademiCDegreeAppIiedfor：SpeciaIit

2、y：Supervisor：2011CaoLichaoMasterBotanythenRuimeiApr．2014独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得西南科技大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。签名：嚼益日期：zp，铲车朔圬历关于论文使用和授权的说明本人完全了解西南科

3、技大学有关保留、使用学位论文的规定，即：学校有权保留学位论文的复印件，允许该论文被查阅和借阅；学校可以公布该论文的全部或部分内容，可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文。(保密的学位论文在解密后应遵守此规定)签名：嚆立超导师签名：i；褒荔杨日期：劢／垆孝朔玷厦西南科技大学硕士研究生学位论文第1页摘要在玉米长达几千年的驯化过程中，由于人们的定向选择导致导致玉米的遗传基础越来越狭窄，多样性水平减少，变异频率降低。大刍草是现在科学界公认的玉米的祖先，具有丰富的遗传变异。大刍草基因组的引入有利于提高玉米的遗传

4、变异水平，开发大刍草的优良性状，发掘和利用玉米在进化过程中丢失或削弱的基因。本实验以玉米优良自交系B73和郑58为轮回亲本，大刍草为染色体片段供体j通过一代杂交、四代回交和五代自交建立了玉米一大刍草渐渗系，并对渐渗系群体BC4F6的穗部表型和植株表型进行了考察，统计了各个性状的变异范围；通过二代测序手段开发了玉米优良自交系郑58和大刍草之间的分子标记，为玉米育种和基础理论研究提供了新的种质和分子标记。主要研究结果如下：1．以B73和大刍草为亲本建立了B73．大刍草BC4F6群体，对渐渗系群体进行了穗部表

5、型和植株表型的统计，穗部表型统计表明，B73．大刍草渐渗系各系的穗长变异范围为4．9．17．5cm；穗行数变异范围为8一18行；行粒数变异范围为10—31粒；粒长变异范围为0．63．1．1cm；轴粗变异范围为1．05．2．91cm；百粒重变异范围为8-389。植株表型统计表明，B73．大刍草渐渗系群体各家系株高变异范围为117．3cm．228．5cm；穗位高变异范围是10．4cm一78．7cm；穗上叶片数变异范围是4．7片；穗下茎节数的变异范围是3．8节；雄穗分枝数的变异范围为2．16；雄穗主轴长变异范

6、围是8．2cm．39．3cm；叶长变异范围为49．7．91．7cm；叶宽变异范围为3．8．12．5cm。2．以郑58和大刍草为亲本建立了郑58．大刍草BC4F6群体，对渐渗系群体进行了穗部表型统计和植株表型统计，穗部表型统计结果表明，穗长变异范围为7．3．15，8cm；穗行数变异范围为8．14行；行粒数变异范围为9．28粒；粒长变异范围为O．69．0．97cm；轴粗变异范围为1．41．2．53cm；百粒重变异范围为20．389。植株表型统计结果表明，株高变异范围为67．1cm．170．2cm；穗位高变异

7、范围为3．7cm．54．8cm；穗上叶片数的变异范围为4．7；穗下茎节数的变异范围为2-6节；西南科技大学硕士研究生学位论文第1I页雄穗分枝数的变异范围是1-9；雄穗主轴长变异范围为6．5—40．8cm；叶长变异范围为16．4cm．85．8cm；叶宽变异范围为2．2．9．3cm。3．本研究对玉米自交系郑58和大刍草的DNA进行多态性的分子标记开发，获得了不低于50000个标签，标签测序深度整体达到5x覆盖度。构建了SLAF．seq文库，筛选出了特异性长度片段，应用高通量测序技术获得海量标签序列。在大刍草

8、和玉米优良自交系郑58之间开发了211个多态性分子标记，包括166个SNP标记和12个Indel标记。这一结果丰富了玉米的分子标记，为研究大刍草的进化和基因克隆提供了新的资源。关键词：B73郑58大刍草渐渗系群体表型统计SNP标记Indel标记西南科技大学硕士研究生学位论文第川页AbstractIntheprocessofdomesticationofcornforthousandsofyears，COrnhasincreasinglyna