刺参snp标记的开发及应用

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1、寸験义＊戀ＯＣＥＡＮＵＮＩＶＩＲＳＩＴＶＯＦＯＨＮＡ硕±学位论文ＭＡＳＴＥＲＤＩＳＳＥＲＴＡＴＩＯＮ论文巧目：刺参ＳＮＰ巧记的开发及应用ＤｅｖｅｌｏｍｅｎｔａｎｄａｌｉｃａｔｉｏｎｏｆＳＮＰｍａｒｋｅｒｓｉｎｐｐｐ■英文Ｓ２：化ｅｓｅａｃｕｃｕｍｂｅｒ化片邱７１＂口ｐｏｗｃｗ目／）作者：重圣巧导教师：李琪教授学位类别：全日制学术学位一．水产养巧专业名称：＇研究方向：水产养殖巧育生物学

2、谨（此论文献给我敬爱的导师和我擎爱的家人及所有关心我、支持我的人们—董玉刺参ＳＮＰ标记的开发及应用学位论文答辩日期：ＷＣ朱ｔ月如白指导教师签字：答辩委员会成员签字：同３－￣Ｗ％ｘ独钥库明本人声明所呈交的学位论义是本人在导师指导下进行的研巧工作及取得的研巧成果。据我所知，除７文中特别加Ｗ标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研巧成果，也不包含未获得（注＝如巧有其他需要特别声明的，本栏可空）或其他教育机构的学位或证书使

3、用过的材料一。与我同工作的同志对本研巧所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名：签字日期；年／月Ｉ日学位论文巧枚使用巧巧书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和破盘，允许论文被査阁和借阅。本人，可授权学校可Ｗ将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索！＾采用。影印、汇编学位论文同时授权中国科学技术信息、缩印或扫描等复制手段保存研究所将本学位论文收录到＜中国学位论

4、文全文数据库》，并通过网络向社会公众提供信息服务。（保密的学位论文在解密后适用本授权书）：学位论文作者签名；导师签字？－？—化—签字日期：月：兴《年《月Ｉ日签字日期兴少年／曰刺参ＳＮＰ标记的开发及应用摘要刺参（／ｆｐｏＷｃＡｏｐｗｙｏｒｐｏｎｋｗｓ）在分类上隶属棘皮动物ｎ（Ｈｏｌｏｔｈｕｒｏｉｄｅａ）、海参纲（Ｅｃｈｉｎｏｄｅｒｍａｔａ）、循手目（Ａｓｐｉｄｏｃｈｉｒｏｔｉｄａ），因其巨大的市场价值成为中国重要的海水养殖品种。ＳＮＰ（Ｓｉｎｇｌｅ

5、ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ），即单核巧酸一多态性，作为种理想的分子标记，、数目多Ｗ二态性、易于髙通量检出等优点在高密度图谱构建、ＱＴＬ分析、遗传多样性评估、家系鉴定和分子育种方面得到了广泛的应用。目前，利用ＥＳＴ数据库是开发ＳＮＰ标记的重要途径。高分辨率一烙解曲线（Ｈｉｇｈｒｅｓｏｌｕｔｉｏｎｍｅｌｔｉｎ，ＨＲＭ）是种商效的突变筛查与基因分型技ｇ－术，具有简单、精确及闭管操作等优点。本研究利用ＨＲＭ技术开发刺参ＥＳＴＳＮＰ标记，并应用于群体遗传

6、多样性分祈和生长性状关联的研巧，为今后刺參的高密度遗传图谱构建、种群结构分析、生物多样性保护和分子标记辅助育种等遗传学研究提供了基础资料。－１．剌多ＥＳＴＳＮＰ标记的开发从ＥＳＴ数据库中检索到７７３９条序列１，经过软件进行聚类拼接后得到８７８，，ｃｏｎ一ｔｓｉ，筛选得到２２９个候选ＳＮＰ位点，通过ＨＲＭ分析方法ｇ，在个刺参养殖群体中对其进行验证和分型。实验结果表明，有５１个候选ＳＮＰ位点表现出多态性，４７个为新开发出的位点；观察杀合度（／／〇）和期望杂合度（化）的范围

7、－－分别为０．０３４５０．５０００和０．的４５０．５６４３，平均值分．２４０５０５。别为０和．３０５２．刺參中田养巧巧体和日本巧生群体遗传多样往比巧选取己开发的ＥＳＴ－ＳＮＰ标记中的３２个位点２个日本野生群体作为参，Ｗ照，运用ＨＲＭ方法对５个刺参中国养殖群体的群体结构和巧传多样性水平进行分析和比较。结果显示Ｉ养殖群体的观测杂合度和期望杂合度与野生群体的没有一ｓｔ１－－明显的不同。而群体间两两对比的ｆ值（０．０１９０．０２％）和巧传致度（０．９８０２化９９

8、１５）也并没有明显的区别。对养殖群体和野生群体的ＡＭＯＶＡ分析指出，变＂＂异的来源在群体内。说明了经过长时间的养殖过程，刺参群体的遗传多样性并没有降化，仍然保持着较离的水平。３．巧参ＳＮＰ标记与生长性状的关联分析一－ＳＮＰ标６个选取已开发的ＥＳＴ记中的４位点，利用个刺参全同胞家系进行了ｒ－ＥＳＴＳＮＰ堪内型与体长、体宽、体重、体瑣重和出肉率性巧的关联分析．相关性４６ＮＰ１０＜０５）分析思示，个Ｓ位点中有个位点与生长性状呈显著相关（尸．０，其中位点ＳＮＰＩ８３的基因