蜗牛酶提取新生隐球菌基因

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时间:2019-07-07

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1、蜗牛酶提取新生隐球菌基因组一、试剂准备1巯基化合物(0.04MEDTA和0.14Mβ-巯基乙醇)(30ml):0.5MEDTA2.4ml巯基乙醇(分析纯ρ=1.11439g/ml)294μl无菌水27.3ml在通风橱中操作,将三者加入50ml离心管中,涡旋震荡混匀,用膜封口,4℃保存。2蜗牛酶的溶解:1)1g市售蜗牛酶(用前4℃保存)。2)配置pH5.8的磷酸钾缓冲液(100ml):1mol/LK2HPO41mol/LKH2PO48.5ml91.5ml3)配置SCPB缓冲液(10ml):1.82g山梨醇、0.042g柠檬酸钠,用10mlpH5.8磷酸钾缓冲液溶解,涡旋震荡混匀,在超净台中

2、,滤器过滤除菌,4℃保存。4)超净台中,将5mlSCPB缓冲液加入到装有1g蜗牛酶的棕色瓶中,轻轻摇动混匀,务必使蜗牛酶完全溶解,用之前用枪头挑一下瓶底,看是否有未溶解的酶,若有则继续摇动或用枪头吹吸之溶解。溶解后的蜗牛酶成为200mg/ml的溶液,4℃保存。3SE缓冲液(30ml):1.5MNaCl3ml;0.5MEDTA(pH8.0)6ml;无菌水21ml。超净台中配置。涡旋混匀,4℃保存。4Ⅱ液(30ml):0.5MEDTA(pH8.0)1.2ml1MTris-Cl(pH8.0)1.5ml无菌水27.3ml超净台中配置。涡旋混匀,4℃保存。510%SDS(30ml):30ml无菌水

3、溶解3gSDS,涡旋溶解,无需灭菌,常温静置。65MKAc(30ml):30ml双蒸水溶解14.73g乙酸钾,高压灭菌,4℃保存,使用前20min置于-20℃冰箱预冷。7氯仿-异戊醇(24:1)(12.5ml):12ml氯仿与0.5ml异戊醇混合均匀,用膜封口,4℃保存。8异丙醇(-20℃);70%乙醇(-20℃);无菌水(4℃)二、实验步骤接菌环挑取一环菌体,接种于液体SDA培养基中,37℃,200转摇培48-72h,准备菌液。实验前准备32℃、65℃水浴和冰盒。1、3-5ml菌液分次加入1.5ml离心管中,室温10000rpm离心1min,弃上清。2、200μl无菌水洗涤菌体(吹吸重

4、悬),室温10000rpm离心1min,弃上清。3、重复步骤2一两次4、用巯基化合物预处理菌体,以提高蜗牛酶作用效果:菌体悬于300-500μl巯基化合物中,32℃水浴15-30min。期间轻轻颠倒离心管两三次。5、室温10000rpm离心1min,弃上清。6、用500μlSCPB缓冲液悬浮菌体,加入100μl蜗牛酶溶液,32℃水浴40min,期间轻轻颠倒离心管五六次。7、室温13000rpm离心2min,弃上清。8、500μlSE液洗涤沉淀,将其吹打悬浮,室温10000rpm离心1min,弃上清。9、重复步骤8五六次。10、加500μlⅡ液和50μl10%SDS,吹打混匀,65℃水浴3

5、0min,期间轻轻颠倒离心管两三次。11、加200μl5MKAc溶液,冰浴30min。12、4℃,12000rpm离心15min。将上清转移新离心管中,计量上清体积。13、加等体积氯仿-异戊醇,剧烈震荡,4℃,6000rpm离心10min,将上清转移至新离心管中。14、重复步骤13一次,计量上清体积。加等体积冷异丙醇,-20度静置10min15、4℃,13000rpm离心10min,弃上清,此时管底应有白色沉淀,用70%冷乙醇洗涤沉淀2-3次,尽去残液,室温晾干沉淀。16、30-50μl无菌水溶解沉淀,-20℃保存。

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