大鼠坐骨神经缺损后背根神经节组织lncRNA表达变化

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1、·306·交通医学2012年第26卷第4期MedJofCommunications，2012，Vo1．26．No．4[文章编号]1006—2440(2012)04—0306—04大鼠坐骨神经缺损后背根神经节组织lncRNA表达变化钱天梅，高蓉，于彬，丁斐，顾晓松(南通大学江苏省神经再生重点实验室，江苏226001)【摘要]目的：研究大鼠坐骨神经缺损后背根神经节中长链非编码RNA0ongnoncodingRNA，lncRNA)的表达变化。方法：建立SD大鼠坐骨神经损伤0天、1天、4天和7天模型，取背根神经节组织进行lncRNA检测，进行差异基因的筛选，并应

2、用实时荧光定量逆转录一多聚酶链反应(qRT—PCR)对芯片结果进行验证；利用lncRNA与mRNA特异性表达的标准化信号强度，构建基因共表达网络。结果：共筛选出24个显著下调的lncRNAs，qRT—PCR检测的lncRNAAF130881和AB020616的表达变化与芯片一致。得到与lncRNAAF130881和AB020616正向或负向共表达的蛋白编码基因25个。结论：大鼠坐骨神经缺损后背根神经节组织中lncRNA的表达谱发生改变。【关键词]坐骨神经缺损；背根神经节；长链非编码RNA；实时荧光定量逆转录一多聚酶链反应；大鼠[中图分类号]R338．1【

3、文献标志码】AAlteredlncRNAexpressionfollowingsciaticnerveresectioninratsQIANTianmei，GAORong，YUBin，DINGFei，GUXiaosong(JiangsuKeyLaboratoryofNeuroregeneration，NantongUniversity，Jiangsu226001)【Abstract】Objective：ToanalyzetheexpressionoflncRNAinthedorsalrootganglia(DRGs)afterresectionofthe

4、sciaticnerveinrats．Methods：TheexpressionoflncRNAswasexaminedinasciaticnerveresectionmodelat0d、1d、4dand7dbyusinganratlncRNAarray．ThelncRNAexpressionwasalsoconfirmedbyquantitativereal-timepolymerasechainreaction(qRT—PCR)．Genecoexpressionnetworkwasconstructedaccordingtothenormalized

5、signalintensityofspe—cificexpressionlncRNAsandmRNAs．Results：Atotalof24lncRNAswereidentifiedwhichweresignificantlydown——regu—latedintheDRGsafterresectionfrom0through1and4until7d．TheexpressionoflncRNAAF130881andAB020616analyzedbyqRT—PCRwasinagreementwiththemicroarraydata．Thenetwork

6、wasconstructedfromlncRNAAF130881andAB020616positivelyornegativelycoexpressedwith25codingmRNAsattheserialtimepoints．Conclusion：ThisstudydemonstratedadiferentinvolvementoflncRNAsintheDRGsafterresectionofthesciaticnerveinaratmode1．【Keywords】sciaticnerveresection；dorsalrootganglia；lo

7、ngnoncodingRNA；Quantitativereal-timepolymerasechainreaction；rats神经损伤的修复与功能重建是当今神经科学研1材料和方法究最受关注的问题之一。周围神经损伤后，神经元会1．1坐骨神经损伤模型的制备SD大鼠24只，雌发生重要表型及生物学变化，从神经递质状态转变雄不拘，由南通大学动物实验中心提供，随机分4为具有再生能力状态，从而有助于周围神经系统再组，每组6只，复合麻醉剂麻醉。手术时暴露大鼠左生ll1。长链非编码RNA(1ongnonCOdingRNA，lncRNA1侧坐骨神经，在距梨状肌下孔0．5c

8、m处切断坐骨神是最近发现的一类非编码RNA分子，转录长度超过经，远侧端截除0．5