hbv阳性肝癌血清mirna标志物的筛选及hbv编码mirna的预测与鉴定

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1、硕士学位论文,MASTERSTHESISHBV阳性肝癌血清miRNA标志物的筛选及HBV编码miRNA的预测与鉴定作者姓名:朱丽敏指导教师:丁先锋副教授专业学科:生物学所在学院:生命科学学院提交日期:2015年1月ZHEJIANGSCI-TECHUNIVERSITYMASTERDISSERTATIONScreeningforserabiomarkerinHBV-positivehepatocellularcarcinomaandpredictionofHBVencodedmiRNADirectedbyCollegeofLifeSciences,ZhejiangSci-TechUniversit

2、yJan,2015HANGZHOU,CHINA分类号:密级:UDC:HBV阳性肝癌血清miRNA标志物筛选及HBV编码miRNA的预测与鉴定ScreeningforserabiomarkerinHBV-positivehepatocellularcarcinomaandpredictionofHBVencodedmiRNA论文答辩日期2015年3月11日答辩委员会主席商晗武教授论文评阅人徐涛教授李素芳研究员金伟波副教授答辩委员会成员刘小川徐涛姜永厚许传莲课题来源浙江省科技厅项目(2012C23072)浙江理工大学硕士学位论文HBV阳性肝癌血清miRNA标志物的筛选及HBV编码miRNA的预测与

3、鉴定摘要肝细胞癌(Hepatocellularcarcinoma,HCC)是我国最常见的恶性肿瘤之一,由于临床缺乏有效的预防、检测及治疗手段,大多数患者发现时已属癌症中晚期,且预后较差,因此寻找可靠的生物标志物用于肝癌诊断和预后判断具有重要意义。MicroRNA(miRNA)是一类内源性的,长度约为22nt的非编码功能性RNA,由于RNAase的保护作用在血清或血浆中表现出高度的稳定性。研究表明miRNA扮演着癌基因或抑癌基因的角色,并能同时调节多个基因,通过结合靶mRNA的方式参与调控肿瘤的发生发展。因此认为miRNA在肝癌和正常血清样本中呈现显著的差异表达水平,对肝癌筛查和诊断具有潜在的指

4、示作用。本论文从杭州西溪医院共收集未经过任何化疗处理的52例肝癌血清样本和25例正常对照样本,对乙型肝炎病毒(HepatitisBvirus,HBV)阳性肝癌样本和正常样本各5例分别混合得到两个混合样,构建miRNA文库进行miRNA表达谱测序。通过对高通量测序所得的数据进行分析处理,共获得172条在肝癌和正常血清样本中差异表达的miRNAs,结合文献报导筛选了三条差异表达的miRNAs进行大样本量验证。相对于正常对照样本,miR-182-5p、363-3p和378a-3p在肝癌样本中显著高表达,并达到极显著水平(P<0.01),且这三条目标miRNAs也能较好地区分HBV阳性肝癌和正常样本,

5、在临床诊断中具有广泛的科研价值和临床应用前景。为探究乙型肝炎病毒是否能够编码miRNA,与宿主mRNA靶向结合来参与病毒感染的调控机制,本论文通过Vir-Mir数据库预测乙肝病毒编码的pre-miRNAs,并结合miRNA表达谱测序和实时荧光定量PCR方法验证成熟体miRNA。结果显示HBV阳性肝癌血清样本中存在六条候选pre-miRNAs,并成功验证其中一条成熟体命名为hbv-miR-15467,为病毒性肝病的治疗策略提供了新的思路。关键词:miRNA;肝癌;生物标记物;乙肝病毒;治疗I浙江理工大学硕士学位论文HBV阳性肝癌血清miRNA标志物的筛选及HBV编码miRNA的预测与鉴定Abst

6、ractHepatocellularcarcinoma(HCC)isoneofthemostpredominantcancersandrepresentsaleadingcauseofmalignancy-relateddeathinChina.Duetothelackofeffectiveprevention,detectionortherapeuticstrategy,themajorityofHCCpatientswerediagnosedwhentheyreachedmediumoreventerminalstage,therefore,screeningpotentialbiomar

7、kerstoeffectivelydetectearlytumordevelopmentisanimportantsteptowardsHCCdiagnosis.MicroRNAs(miRNA)areaclassofendogenous,noncodingRNAswith~22nucleotidesinlengthwhichhavehighstabilityinhumanserumorplasma

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