规模化猪场猪嵴病毒感染状况其3d基因变异的分析

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1、...页眉分类号：单位代码：10019密级：学号：SY10040131规模化猪场猪嵴病毒感染状况及其3D基因变异分析姚晶硕士学位论文规模化猪场猪嵴病毒感染状况及其3D基因变异分析AnalysesofPorcineKobuvirusInfectionStatusandIts3DGeneVariationinIntensivePigFarms研究生：姚晶指导教师：郭鑫教授合作指导教师：王云龙畜牧师申请学位门类级别：兽医硕士专业领域名称：畜禽疫病防治研究方向：猪病所在学院：动物医学院二O一二年五月....页脚...页眉独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的

2、研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得中国农业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名：时间：年月日关于论文使用授权的说明本人完全了解中国农业大学有关保留、使用学位论文的规定，即：学校有权保留送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意中国农业大学可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。(保密的学位论

3、文在解密后应遵守此协议)研究生签名：时间：年月日导师签名：时间：年月日....页脚...页眉摘要猪嵴病毒（porcinekobuvirus）属于微RNA病毒科嵴病毒属，同属成员还有能够引起人肠道感染的爱知病毒（Aichivirus）和牛嵴病毒（bovinekobuvirus）。2008年，猪嵴病毒感染在匈牙利首次报道。已有研究显示，猪嵴病毒感染与腹泻有关。本研究应用RT-PCR技术对北京顺义区两个规模化猪场采集的粪便样本进行了猪嵴病毒的检测，以期了解猪嵴病毒在猪群中的感染状况，并分析了病毒3D基因的变异情况，旨在为我国猪嵴病毒感染的流行病学及其相关研究提供基础数据。采

4、集不同生产规模的两个规模化猪场（A场和B场）猪群肛拭子粪便样本共计1190份，应用RT-PCR技术扩增猪嵴病毒3D部分基因片段。结果显示，阳性样本133份，总阳性率为11.18%。其中，A场阳性率为13.56%（80/590）；B场阳性率为8.83%（53/600）。对不同生长阶段猪群样本的检测结果显示，保育猪群阳性率最高，为25.83%，其次是哺乳仔猪，阳性率为17.91%，育肥猪阳性率为8.33%，经产母猪及公猪群阳性率最低，为1.70%。不同季节采样检测结果显示，冬春季节采集的样本检测阳性率（13.71%）明显高于秋季样本（3.67%），A场春季样本阳性率高，B

5、场冬季样本阳性率高。对扩增得到的74个猪嵴病毒3D部分基因片段进行克隆、测序及分析。结果显示，与匈牙利毒株S-1-HUN相比，74个序列中6个存在10个核苷酸的定点插入，1个序列存在9个核苷酸缺失，分析这7个序列推导的氨基酸序列显示，这些插入或缺失引入了终止密码子，其突变可能为致死性突变。其余67个扩增序列推导的氨基酸序列的同源性为94.6%～100%。与国内外8个猪嵴病毒代表毒株序列进行同源性比较显示，67个扩增序列与S-1-HUN毒株的同源性最高。从构建的进化树可以看出，A场的嵴病毒毒株与韩国源swine/MF8045/2009/KOR及国内毒株Z442和pig/

6、Ch1/2008/CHN的亲缘关系较近，而B场的嵴病毒毒株与韩国源的97DA4毒株及国内pig/Ch13/2008/CHN毒株的亲缘关系较近。综上结果表明，监测的规模化猪场的不同生长阶段猪群均存在猪嵴病毒感染；猪群中猪嵴病毒毒株具有多样性和变异性。关键词：猪嵴病毒；感染；RT-PCR；检测；序列分析；变异Abstract....页脚...页眉PorcinekobuvirusisclassifiedintothegenusKobuvirusinthefamilyPicornaviridae,togetherwithAichiviruscausinghumanintest

7、inaltractinfectionandbovinekobuvirus.PorcinekobuviruswasfirstidentifiedinHungaryin2008.Somestudieshaveindicatedthatporcinekobuvirusinfectioniscertainlyinvolvedindiarrheadisease.Inthisstudy,porcinekobuvirusinfecalsamplesfromtwopigfarmsinBeijingwasdetectedbyRT-PCRinordertounderst