河鲈野生群体和养殖群体遗传多样性比较研究

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1、分类号：密级：学号：2012103017单位代码：10759石河子大学硕士学位论文河鲈野生群体和养殖群体遗传多样性比较研究学位申请人武菲指导教师胡文革副教授申请学位门类级别理学硕士学科、专业名称水生生物学研究方向水生生物遗传多样性与繁育所在学院生命科学学院中国·新疆·石河子2015年6月AComparativeAnalysisofGeneticDiveritybetweentheCultivatedandNaturalPercaFluviatilis.ADissertationSubmittedtoShiheziUniversityInPartialFulfillmentoftheReq

2、uirementsfortheDegreeofMasterofNaturalScienceByWufei(Aquaticbiology)DissertationSupervisor:Prof.HuWen-geJune,2015石河子大学学位论文独创性声明及使用授权声明学位论文独创性声明本人所呈交的学位论文是在我导师的指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知，除文中已经注明引用的内容外，本论文不包含其他个人已经发表或撰写过的研究成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体，均已在文中作了明确的说明并表示谢意。研究生签名时间：年{月7曰使用授权声明本人完全了解石河子大学有关保留、使用学位

3、论文的规定，学校有权保留学位论文并向国家主管部门或指定机构送交论文的电子版和纸质版。有权将学位论文在学校图书馆保存并允许被查阅。有权自行或许可他人将学位论文编入有关数据库提供检索服务。有权将学位论文的标题和摘要汇编出版。保密的学位论文在解密后适用本规定。研究生签名时间：J20/5年<月？日导师签名：.时间：•年<月7曰摘要本文通过线粒体DNA控制区全长序列和细胞色素b基因部分片段遗传标记辅以简单形态学数据测量，分析比较了分布在新疆北屯、乌伦古湖、博斯腾湖的3个河鲈野生群体和北湖、五家渠的2个河鲈养殖群体的遗传多样性。为河鲈的野生群体种质资源的复壮及可持续开发利用和人工养殖群体优良种质资源

4、的培育提供一定的理论参考基础，结果如下：1.在欧洲河鲈已识别部分保守序列基础上，对新疆河鲈线粒体DNA控制区全序列测定后进一步识别了中央保守区的CSB-F、CSB-E、CSB-C和CSB-B的序列。划分出河鲈线粒体DNA控制区的终止序列区(TAS)、中央保守区(CD)和保守序列区(CSB)的界限。对新疆河鲈、欧洲河鲈和黄金鲈三者间以及新疆河鲈的野生和养殖群体两者间进行了mtDNA控制区碱基结构组成分析，发现在终止序列区（TAS）的碱基结构组成上，新疆河鲈以4个重复序列为主，欧洲河鲈以3个重复序列为主，而黄金鲈只有4个重复序列，并且三者在控制区其它区域也存在差异，与欧洲河鲈相比，新疆河鲈和

5、黄金鲈出现了部分碱基的缺失；新疆河鲈野生群体的重复序列碱基变异类型多于养殖群体。以圆斑星鲽为外群，用邻接法(NJ)构建系统发育树表明，欧洲河鲈和新疆河鲈分为两个明显谱系，新疆河鲈的野生群体和养殖群体未出现分支，亲缘较近。2.河鲈养殖群体和野生群体共获得100条线粒体DNA控制区全长序列，其长度为877bp、878bp、867bp不等，检测到16个单倍型，26个变异位点。其中60个野生群体个体检测到18个变异位点和13个单倍型，40个养殖群体个体检测到8个变异位点和5种单倍型；河鲈野生群体平均单倍型多样性和平均核苷酸多样性（Hd=0.688±0.056，Pi=0.0023±0.0011）高

6、于养殖群体（Hd=0.612±0.078，Pi=0.0015±0.00075）；群体间的遗传分化表明除北屯与乌伦古湖群体间、北屯与五家渠群体间呈中度分化外（FST>0.15），其余两两群体间均呈显著分化（FST>0.25）。养殖与野生群体之间的基因交流较小（0.81034-1.96950）。分子系统树和单倍型网络图分析表明，河鲈单倍型间关系较近,各群体处于分化早期，未积累足够的遗传变异。3.100尾河鲈个体的线粒体细胞色素b基因部分序列片段长度大小为421bp，共检测到7个单倍型，10个变异位点。其中野生群体60个个体检测到9个变异位点和6个单倍型，养殖群体40个个体共检测到8个变异位点

7、和4种单倍型；河鲈野生群体平均单倍型多样性和平均核苷酸多样性（Hd=0.496±0.121，Pi=0.00253±0.00154）高于养殖群体（Hd=0.416±0.127，Pi=0.00123±0.00113），分子方差分析揭示，98.74%的遗传变异性出现在种群内个体间。群体间的FST分析揭示野生群体和养殖群体分化程度较低（0.05