用合并holstein群体进行基因组预测及gwas

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1、１１：００９分类号；单位代码密级：学号；Ｂ１２０３２７２ｆ巧方ｔ乂夺学位论文用合并Ｈｏｌｓｔｅｉｎ群体进行基因组预测及ＧＷＡＳＭｅｔｈｏｄｓｔｏｉｍｐｒｏｖｅｅｎｏｍｉｃｒｅｄｉｃｔｉｏｎａｎｄＧＷＡＳｕｓｉｎｇｇｐｃｏｍｂｉｎｅｄＨｏｌｓｔｅｉｎｏｕｌａｔｉｏｎｓｐｐ研究生；李秀余指导教师；张勒教授合作指导教师；苏国生教授下向东副研究员申请学位口类级别：农学博±专业名称；动物遗传育种与繁殖研究方向；分子数量遗传学所在学

2、院：动物科学巧术学院２０１５年１１月分类巧；单位代码：１００１９密级：学号；Ｂ１２０３２７２ｆ的少ｔ乂聲学位论文用合并Ｈｏｌｓｔｅｉｎ群体进行基因组预测及ＧＷＡＳＭｅｔｈｏｄｓｔｏｉｍｐｒｏｖｅｇｅｎｏｍｉｃｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎａｎｄＧＷＡＳｕｓｉｎｇｃｏｍｂｉｎｅｄＨｏｌｓｔｅｉｎｏｌａｔｉｏｎｓｐｐｕ研究生：李秀金＊旨导教：张勤孝女授以币合作指导教师：苏国生教授Ｔ向东副研巧员申请学位口类级别：农学博±专业

3、名称：动物遗传育种与繁殖研究方向：分子数景溃传学所在学院：动物科学技术学院２０１５年１１月ＣｈｉｎａＡｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｇｙＰｈ．Ｄ．ＤｉｓｓｅｒｔａｔｉｏｎＭｅｔｈｏｄｓｔｏｉｍｐｒｏｖｅｅｎｏｍｉｃｒｅｄｉｃｔｉｏｎａｎｄＧＷＡＳｕｓｉｎｇｐｇｃｏｍｂｉｎｅｄＨｏｌｓｔｅｉｎｏｕｌａｔｉｏｎｓｐｐＰｈ．Ｄ．ｃａｎｄｉｄａｔｅ：ＸｉｕｉｎＬｉｊＳｕｅｒｖｉｓｏｒ：Ｐｒｏｆ．ｉｎＺｈａｎｐＱｇ－Ｃｏｓｕｅｒｖｉｓｏ

4、ｒ：Ｐｒｏｆ．ＧｕｏｓｈｅｎＳｕｐｇＡｓｓｏｃｉａｔｅＰｒｏｆ．ＸｉａｎｇｄｏｎｇＤｉｎｇＭａｏｒ：ＡｎｉｍａｌＧｅｎｅｔｉｃｓａｎｄＢｒｅｅｄｉｎｊｇＲｅｓｅａｒｃｈｆｉｅｌｄ：ＭｏｌｅｃｕｌａｒｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅＧｅｎｅｔｉｃｓＱＩｎｓｔｉｔｕｔｅ：ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＡｎｉｍａｌＳｃｉｅｎｃｅａｎｄＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙＢｅｉｉｎ１００１９３ｊｇ，Ｎｏｖｅｍｂｅｒ２０１５，本研究是由丹麦的ＧｅｎＳＡＰ项目和农业部引进国际先进农业科

5、学技术计划（９４８计划）Ｎ〇－．２０１１Ｇ２ＡＰ＾（资助ＴｈｉｓｗｏｒｋｗａｓｓｕｐｐｏｒｔｅｄｂｙＴｈｅＧｅｎＳＡＰｒｅｓｅａｒｃｈｒｏｅｃｔｏｆＤｅｎｍａｒｋｐｊａｎｄ‘，ｎＴｈｅ９４８Ｐｒｏｅｃｔｏｆ化ｅＭｉｎｉｓｔｒｏｆＡｒｉｃｕｌｔｕｒｅｏｆＣｈｉａｊｙｇＮＯ－．２０１１Ｇ２Ａ口（））独创性声明本人声明所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研巧成果。尽我所知，除了文中己经注明引用和致谢的内容外，论文中不包含本人和其

6、他人己经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得中国农业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料一。与我同工作的同志对本研巧所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。学位论文作者签名：去ｆ金时间：如１＾／＾月＾日关于学位论女使用授权的说明本人完全了解中国农业大学有关保留、使用学位论文的规定。本人同意中国农业大学有权保存及向国家有关部口和机构送交论文的纸质版和电子版，允许论文被查阅和借阅：本人同意中国农业大学将本学位论文的全部或部分内容授权汇编录入《中国博±学位论文全

7、文数据库》或《中国优秀硕±学位论文全文数据库》进行出版，并享受相关权益。（保密的学位论文在解密后应遵守此协议）学位论文作者签名：秦＾全时间：王。仪年Ｕ月ｆ日＂导师签名：时间：化年月务日摘要一レ家畜的重要经济性状通常是复杂性状，它们般会受到基因因素，环境因素义及基因与环境互作共同的作用。如果基因与环境互作存在，这，却被人们所忽略会造成育种值估计会出现偏差Ｗ及影响最优选择的进行。同时，全基因姐关联分析（ＧＷＡＳ）和全基因组预测最近被广泛用于提高家畜的遗传进展中。因此，本博±课题的目标是

8、利用来自不同国家的不同Ｈｏｌｓｔｅｉｎ群体进行Ｓ和基因姐，同时探索存在于不同国家间的基因和环境互作现象多群体ＧＷＡ预测。一中，我们探索加入北欧和法国Ｈｏｌｓｅｉｎｌｓｔｉｎ在研究ｔ群体对巴西Ｈｏｅ群体３个产奶性状（产一奶量，乳脂量和就蛋白量。本研究中－个生物学）育种值预测可靠性的影响两个性状定义为同Ｐ一ＢＬＵＰ