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《雌核发育银鲫微卫星突变速率和突变模式》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、HEREDITAS(Beijing)2008年4月,30(4):483―490ISSN0253-9772www.chinagene.cn研究报告DOI:10.3724/SP.J.1005.2008.00483雌核发育银鲫微卫星突变速率和突变模式1,21111刘晓锋,鲁翠云,曹顶臣,孙效文,梁利群1.黑龙江水产研究所北方鱼类生物工程育种重点开放实验室,哈尔滨150070;2.大连水产学院生命科学与技术学院,大连116023摘要:银鲫是天然雌核发育的三倍体两性型种群,因其遗传背景和生殖方式的特殊性,已经成为研究单性和多倍体脊椎动物进化遗传学的理想模式鱼
2、类。利用33个微卫星序列对雌核发育银鲫的突变速率和突变模式进行研究,结果表明:(1)22个子代个体中,检测到1尾个体在15个微卫星位点具有18个突变等位基因;(2)每个微−2−3−2卫星位点每代总体平均突变率是1.16×10,95%置信区间是6.87×10~1.83×10,与其他鱼类相比,雌核发育银鲫的突变率明显偏高,这与天然雌核发育鱼类处在单性生殖和两性生殖的过度阶段有密切关系;(3)具有突−2变等位基因的13个位点的重复单元数目都在10次以上,11个复合型微卫星位点的突变率(1.31×10)与21个完−2美型位点(1.00×10)的突变率没有明
3、显差异(P=0.67),微卫星突变率受到重复单元数目的影响,然而与重复结构类型和侧翼序列GC碱基含量无相关性;(4)序列分析表明,雌核发育银鲫的微卫星突变模式并不严格遵守逐步突变模型。关键词:银鲫;微卫星;突变Mutationrateandpatternofmicrosatellitesingynoge-neticsilvercruciancarp(Carassiusautatusgibeblio)1,21111LIUXiao-Feng,LUCui-Yun,CAODing-Chen,SUNXiao-Wen,LIANGLi-Qun1.Heilongj
4、iangFisheriesResearchInstitute,ChineseAcademyofFisherySciences,Harbin150070,China;2.CollegeofAqua-lifeScienceandTechnology,DalianFisheriesUniversity,Dalian116023,ChinaAbstract:Thenaturalgynogenetictriploidsilvercruciancarp(CarassiusautatusgibeblioBloch)providesagoodsystemforst
5、udyingevolutionalgeneticsoftheunisexualandpolyploidyvertebrate.Microsatellitesareabundantacrossgenomesandshowhighlevelsofpolymorphismandmutationalrate,sotheyhavebeenwidelyusedforstudyingevolutionalbiology.Inthisstudy,themutationrateandpatternat33microsatellitelociofsilvercruci
6、ancarpwereinvestigated.Asaresult,itwasfoundthattheonlyoneof22offspringhad18mutantallelesat15microsatelliteloci.Theoverallmutationrateofthe−2−3−233lociwas1.16×10/locus/generation(95%confidenceinterval6.87×10and1.83×10).Themutationrateinthegyno-genetictriploidsilvercruciancarpwa
7、sobviouslyhigherthanotherfish,whichwascloselyrelatedtothetransitionalphaseofparthenogenesisandgamogenesisinthenaturalgynogeneticfish.Therepeatnumbershadmorethan10timesat13lociofthemutantalleles,andtherewasnoobviouslydifferentinthemutantratebetweenthe11compoundmicrosatelliteloc
8、i−2−2(1.31×10)andthe21perfectmicrosatelliteloci(1.00×10)(P=0.