长非编码rna在脂肪干细胞脂向分化的差异性表达分析

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1、长非编码RNA在脂肪干细胞脂向分化的差异性表达分析中文摘要【目的】成脂分化是一个复杂的过程的,涉及激素刺激,信号转导,基因表达及细胞形态学改变,整个成脂分化是一个由许多转录因子参与形成的网络。lncRNAs可在不同的生物进化过程中发挥作用,包括细胞周期调控,免疫监视,胚胎干细胞多能性等,然而其在成脂分化的分子机制仍未清楚。本研究通过人脂肪来源干细胞(adipose.derivedstemcells,ADSCs)定向脂向诱导分化,成功鉴定后应用高通量筛选技术筛选出有差异表达的lncRNAs,并预测其作用的靶基因。初步建立ADSCs!旨向分化中lncRNAs的相关调控基因、细胞因子

2、表达的网络,找lncRNAs在成脂分化过程中的启动机制及调控通道,为肥胖症的基础治疗提供理论依据。【方法】组织块培养法培养361健康人的ADSCs,对第三代细胞进行流式细胞仪鉴定。每例细胞标本随机分成三组(0d、5d$112d),分别成脂诱导培养5d和12d后进行油红0染色鉴定。对所有样本进行总IⅢA抽提及质量检测。对每个样本约5“g总RNA进行标记及列阵杂交,应用AxonGenePix4000B微阵点扫描仪扫描芯片的荧光强度。扫描图像输入NimbleScan2.5软件进行网格定测和数据表达分析,通过分位数标准化和软件内置的稳定多片平均值(RMA)对表达数据进行标准化,所有的l

3、ncRNAs被输入到软件AgilentGeneSpringGX11.5.1中进行lncRNAs差异表达谱筛选。每个样本重复筛选3次,将lncRNAs的所有目标值的标准化值≥100挑选出进行数据分析。最后分层聚类分析有差异表达的lncRNAs的表达模型。【结果】第3代ADSCs代表面抗原表达CD29,CD44,CD90,CDl05表达阳性。CD34,CD45,CDl06表达阴性。第3代人脂肪干细胞经成脂诱导剂分别培养5d。12d后用油红O染色,计数脂滴数量,第5d和第12d的脂肪颗粒数是5%和41%。第3代人脂肪干细胞经成骨诱导液诱导后倒置相差显微镜下观察,茜素红染色阳性。总RN

4、A抽提及质量检测结果所有样本A260/A280值在1.80~2.10,均符合要求。对扫描超过1800个人lncRNAs表达谱筛选,人工分析出5个3.0倍以上持续上调的lncRNAs和4个3.0倍以上持续下调的lncRNAs,其中6个有对应的靶基因,3个没有靶基因,只有LncRNAs所在染色体的位置和序列。【结论】本研究通过对人脂肪来源间充质干细胞脂向诱导分化的lncRNAs筛选,得出差异性表达谱,它们可能参与脂肪干细胞脂向分化的调控机制和肥胖症发生,为进一步研究脂肪干细胞成脂分化的信号通路提供新的实验依据。【关键词】脂肪干细胞;成脂分化;lncRNAs测序;lncRNAs表达谱

5、DifferentialExpressionandSignificancesoflncRNAsinHuman【Objective】adipose—derivedstemcells.AbstractAdipogenicdifferentiationisacomplicatedprocessthatincludeshormonestimulus,signaltransduction,geneexpressionchanges,andcellmorphologicalchanges,anetworkformedbymanytranscriptionfactorsisinvolvedi

6、ntheentireadipogenicdifferentiationprocess.GeneexpressionpattemshaveimplicatedtheselincRNAsindiversebiologicalprocesses,includingcell—cycleregulation,immunesurveillance,andembryonicstemcellpluripotency.However,thelncRNAsmolecularmechanismsleadingtoADSCadipogenicdifferentiationisstillnotclear

7、.Thisresearchwillbetoinvestigatehumanadipose—d耐vedstemcells(ADSCs)inducesintoadiposecellsbytissureculture.Afteridentifiedusinghigh-throughputscreeningscreenoutthedifferentiallyexpressedlncRNAsfromthegeneticlevel,andpredictitstargetgenes.Finally,ini

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