人骨髓间充质干细胞成骨分化相关的长链非编码RNA表达谱特征-论文.pdf

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1、广东医学2015年5月第36卷第9期GuangdongMedicalJournalMay．2015，Vo1．36，No．9·1309·≯磷盱人骨髓间充质干细胞成骨分化相关的长链非编码RNA表达谱特征冰孙翔，赵建江，贾搏，韩久松，邱小玲，褚洪星，郑相淮南方医科大学附属口腔医院、广东省口腔医院口腔颌面外科(广州510280)【摘要】目的观察人骨髓间充质干细胞(hMSCs)成骨分化过程中长链非编码RNA(1ncRNA)的表达谱变化。方法以hMSCs及成骨诱导分化7、14、21d后的细胞为研究对象，利用Agilentl

2、ncRNA芯片技术筛选出成骨诱导分化前后2倍变化幅度的差异lncRNA，并通过实时荧光定量PCR(RT—PCR)对芯片结果进行验证。选取筛选结果中表达差异较大的lncRNA利用UCSCGenomeBrowser并结合芯片筛选结果分析lncRNA邻近蛋白编码基因。结果hMSCs经成骨诱导分化7、14、21d后，均具有成骨细胞特性；芯片筛选结果表明，与成骨诱导分化前的hMSCs相比，成骨诱导分化7、14、21d后持续表达上调超过2倍的lncRNA有433条，下调超过2倍的有232条；选取其中部分lncRNA，RT—

3、PCR验证与芯片结果相符合；对lncRNA邻近蛋白编码基因分析提示某些lncRNA(如lncRNAENST00000585537．1和lncRNAeHIT00001595)可能在hMSCs成骨分化过程中发挥重要作用。结论hM—SCs成骨诱导分化前后，lncRNA表达谱发生显著变化，提示差异表达的lncRNA可能与hMSCs成骨分化密切相关，由此可进一步解释hMSCs成骨分化机制。【关键词】人骨髓间充质干细胞；成骨分化；长链非编码RNAExpressionprofileoflongnon——codingRNAsi

4、nvolvedinosteogeniediferentiationofhumanmarrow——derivedmesenchymalstemeeHs．SUNXiang，ZHAOJian-fiang，JIABo，HANJiu—song，QIUXiao—ling，CHUHong—xing，ZHENGXiang—huai．DepartmentofOralandMaxillofacialSurgery，theAfiliatedStomatologicalHospitalofSouthernMedicalUniversi

5、ty，GuangdongProvincialStomatologicalHospital，Guangzhou510280，ChinaCorrespondingauthor：ZHAOJian—jiang．E—mail：zJ)2521@sina．corn【Abstract】ObjectiveToanalyzetheexpressionprofilevariationoflongnon—codingRNA(1ncRNA)duringosteogenesisofhumanmarrow—derivedmesenchyma

6、lstemcells(hMSCs)．MethodsOsteoblast—induceddifferentia—tionwasperfomedonhMSCs．UsingAgilentlncRNAmieroarray，samplesofhMSCsanddifferentiatedhMSCsonthe7，14and21“daywereassayedtoidentifythetargetlncRNA．whichwasalteredmorethan2timesduringosteogenesisofhMSCs．Theex

7、pressionoflncRNAwasverifiedbyrealtimequantification—polymerasechainreactionfRT—PCR)．Spe—cificlncRNAsrelatedprotein—codinggenesusingtheUCSCGenomeBrowsercombinedwithmicroarrayresults．ResultsOsteogeniccharacteristicswereobservedininducedhMSCsonthe7．14and21day．A

8、ccordingtomicroarrayanaly—sis，433IncRNAswereconstantlysignificantlyup—regulatedmorethan2timesand232lncRNAsconstantlysignificantlydown—regulatedmorethan2timesduringtheosteogenesisofhMSCs．Theresuh