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时间:2018-11-02
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1、等位基因特异性PCR技术在DEL表型基因分型中的【摘要】目的:建立DEL表型的基因分型方法,用于快速鉴定DEL表型。方法:用RHBox基因分型方法鉴定标本的基因型,用血清学方法确定标本的DEL表型。根据RHD1227A等位基因序列设计等位基因特异性聚合酶链反应(allelespecificpolymerasechainreaction,ASPCR),用于DEL表型基因分型,结果同血清学的方法作比较,探讨临床应用的可行性。结果:28例RHBox基因分型为RHD-/RHD-的标本,血清学方法、基因分型方法DEL表型鉴定结果均为阴性;在25例RHBox基因分型为RHD+/RH
2、D-或RHD+/RHD+的标本中,用血清学方法检出的11例DEL表型标本,基因分型方法均扩增到867bp的1227A等位基因条带;1例血清学方法阴性,而基因分型方法检测为阳性,后经测序分析证实RHD1227A为阳性,分析此例标本可能为血清学方法漏检。这说明在鉴定DEL表型的方法中基因分型方法比血清学有更高的灵敏度。结论:ASPCR方法可用于临床筛选Rh阴性人群中的DEL表型。【关键词】Rh血型DEL表型;RHD1227A等位基因;基因分型 [Abstract]Objective:ToestablishagenotypingmethodforDELphenotypeofhu
3、manbloodgroupsystem.Methods:ThegenotypeinedbyusinggenotypingmethodofRHBox,andDELphenotypeinedbyserologicalmethod.Anallelespecificpolymerasechainreaction(ASPCR)ethodethod,thefeasibilityofthegenotypingmethodinclinicalpracticesplesethodandgenotypingmethodforDELphenotype.In25RHD+/RHD-andRHD+/
4、RHD+samples,11DELphenotypepositivesamplesethod.HopleethodforDELgenotype.Thissampleinedpositivebysequencinganalysis.GenotypingmethodforDELphenotypehadhighersensitivitythanserologicalmethod.Conclusion:TheASPCRmethodcanbeusedforscreeningDELphenotypeamongthepopulationnegativeofRHDantigen. [Ke
5、yl,EDTANa2抗凝,采用试剂盒提取全血DNA(EZBDC血液基因组DNA快提试剂盒,济南泰天和生物科技有限公司),分装-80℃保存备用。 1.4RHD基因分型 采用RHBox基因分型试剂盒(GT,美国)PCR反应总体积9μl,含7μlPCR引物混合液,1μlDNA样品,1μlTaq酶(含0.33~0.5单位)。PCR扩增条件:95℃30s,60℃30s,72℃90s,30个循环后置72℃再延长5min。使用0.5×TBE缓冲液,配制2%琼脂糖凝胶,以10V/cm电泳30min,结果通过凝胶成像仪(FR200A全自动紫外与可见分析装置,上海复日科技)拍照成像。
6、 1.5RHD1227A基因分型 采用吴俊杰等[5]的方法根据RHD基因和RHD1227A等位基因相关序列设计一组特异性扩增RHD1227A等位基因的引物(上海生工生物技术公司合成)。RHDels:5′GACCAAGTTTTCTGGAAA3′(位置对应于AJ299028的6885),RHDela:5′CGAGAGAATTTTGAGCAC3′(位置对应于AB035185的849832)。一对特异扩增人GAPDH基因240bp的引物作为内对照,GAPDHF:5′TGATGACATCAAGAAGGTGGTGAAG3′,GAPDHR:5′TCCTTGGAG
7、GCCATGTGGGCCAT3′。总反应体积为10μl,含模板DNA0.2μl,特异性引物终浓度250nmol/L,内对照引物终浓度50nmol/L,MgCl2终浓度1.5mmol/L,dNTP终浓度200μmol/L,Taq酶0.2U。PCR扩增条件:95℃预变性5min,然后95℃30s,58℃30s,72℃50s,30个循环后72℃再延长5min。使用0.5×TBE缓冲液,配制2%琼脂糖凝胶,以10V/cm电泳30min,结果通过凝胶成像仪拍照成像。 2结果 2.1Rh表型确定 通过凝集试
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