酿酒酵母代谢工程菌构及代谢工程研

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1、.1木糖还原酶编码序列(XYL1F)的克隆转化1.1ATCC58785树干毕赤酵母基因组的提取1.1.1菌体干粉的制备123图1ATCC58785基因组提取结果将培养20h的树干毕赤酵母于4500rpm离心10min后收集菌体沉淀,真空干燥,500ml发酵液约得到1.3g干燥菌粉。1.1.2基因组的提取采用OMEGAFungalDNAMiniKit进行基因组提取。1.1.3电泳检测1:λ-HindⅢdigest(3.5uL)2:21mg菌粉提取的基因组(5uL)3:31mg菌粉提取得基因组(5uL)1.2XYL1基因的PCR扩增1.2.1第一次PCR(1)反应体系Temp

2、lateDNA2.0ul10×buffer5.0ulMgCl2(25mmol/L)6.0ulX1-primer1(25umol/L)1.0ulX1-primer2(25umol/L)1.0uldNTP(2mmol/L)4.0ulTaq酶(5u/L)1.0ul灭菌超纯水补齐至50ul(2)PCR扩增程序为:94℃4min94℃30S61℃30S20个循环72℃60S72℃10min4℃保存12345End(3)电泳检测1:100bpDNAladder(3.5uL)2:100bpDNAladder(3.5uL)3:21mg菌粉提取得基因组作为模版(5uL)4:31mg菌粉提取

3、得基因组作为模版(5uL)5:31mg菌粉提取的基因组作为模版(5uL)PCR扩增失败。1.2.2Tm值的摸索(1)反应体系图2XYL1基因的PCR扩增结果TemplateDNA1.0ul10×buffer2.0ul..MgCl2(25mmol/L)1.5ulX1-primer1(25umol/L)0.5ulX1-primer2(25umol/L)0.5uldNTP(2mmol/L)2.0ulTaq酶(5u/L)0.5ul灭菌超纯水补齐至20ul(2)PCR扩增程序为:94℃4min94℃30S52~62℃50S30个循环72℃90S72℃10min4℃保存End1654

4、32165432图3XYL1PCR中Tm摸索结果(3)电泳检测上1:100bpDNAladder(1.5uL)上2:PCRTm为52.3℃(10ul)上3:PCRTm为53.7℃(10ul)上4:PCRTm为54.8℃(10ul)上5:PCRTm为53.7℃(10ul)上6:PCRTm为52.3℃(10ul)下1:100bpDNAladder(1.5uL)下2:PCRTm为56.3℃(10ul)下3:PCRTm为58.0℃(10ul)下4:PCRTm为59.4℃(10ul)下5:PCRTm为61.3℃(10ul)下6:PCRTm为62.0℃(10ul)所以选52.3℃为X

5、YL1PCR扩增时的退火温度。1.2.3XYL1的PCR扩增(1)反应体系①反应体系1TemplateDNA2.5ul10×buffer5.0ulMgCl2(25mmol/L)3.75ulX1-primer1(25umol/L)1.25ulX1-primer2(25umol/L)1.25uldNTP(2mmol/L)5.0ulTaq酶(5u/L)1.2ul灭菌超纯水补齐至50ul②反应体系2TemplateDNA2.5ul10×buffer5.0ulMgCl2(25mmol/L)3.75ulX1-primer1(25umol/L)0.5ul..X1-primer2(25u

6、mol/L)0.5uldNTP(2mmol/L)5.0ulTaq酶(5u/L)1.25ul灭菌超纯水补齐至50ul③反应体系3TemplateDNA2.0ul10×buffer5.0ulMgCl2(25mmol/L)6.0ulX1-primer1(25umol/L)1.0ulX1-primer2(25umol/L)1.0uldNTP(2mmol/L)4.0ulTaq酶(5u/L)1.0ul灭菌超纯水补齐至50ul(2)PCR扩增程序为:94℃4min94℃30S52.3℃50S30个循环72℃90S1234图4XYL1的PCR扩增结果72℃10min4℃保存End(3)电

7、泳检测1:100bpDNAladder(2.5uL)2:反应体系3(25ul)3:反应体系3(25ul)4:反应体系3(25ul)反应体系1的扩增结果较好。1.3XYL1基因的凝胶回收1.3.1凝胶回收本次胶回收采用上海生工UNIQ-10柱式DNA胶回收试剂盒进行1.123图5XYL1的胶回收结果3.2电泳检测1:100bpDNAladder(2.5uL)2:胶回收后的XYL1(5ul)3:T质粒片段(5ng/ul,5ul)1.4XYL1与T质粒连接和转化反应体系15ul实验组阳性对照因性对照2×RapidLigationBu

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