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时间:2018-05-08
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1、浅析对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的基因多态性分型研究的论文【摘要】目的探索一种准确、快速、可靠的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(mrsa)的分子生物学分型方法,了解医院内mrsa的多态性,为临床合理、有效地使用抗生素和控制耐药基因在种群间的传播提供帮助。方法用meca基因相关高变区pcr扩增(hvr-pcr)和随机扩增多态性dna(rapd)两种方法,对mrsa菌株进行多态性分析。hvr-pcr检测meca基因相关高变区正相重复序列元件(drus)的长度,根据drus数目的不同对mrsa分型;rapd根据电泳图谱中条带的数目及位置,经ntsys统计软件进行聚类分析,得到遗传树状图,按mrsa菌株之间的
2、相关性进行分型。结果应用hvr-pcr方法可将31株mrsa标本分为7型,分别含有7、8、9、10、11、12和16个drus,其中10drus型最多[11/31(35.48%)],16drus型最少[1/31(3.23%)];应用rapd分型,31株mrsa共分10型,其中以ⅳ型为主[10/31(32.26%)],其他型分布比较接近。在11株hvr-pcr分型的10drus型中rapdⅳ型4株[4/11(36.36%)],rapdⅲ型和rapdⅳ型各2株[2/11(18.18%)];10株rapdⅳ型中9drus型、10drus型各4株[4/10(40.00%)]。结
3、论rapd方法和hvr-pcr方法对mrsa的分型率都比较高,而且这两种方法都比较简单、稳定、可靠、快速,实用性强,具有广阔的应用前景。.【关键词】耐甲氧西林金黄色葡萄球菌;meca基因;随机扩增多态性dna;meca基因相关高变区pcr扩增 abstract:objectivetoinvestigatethepolymorphismsofmethicillin-resistantstaphylococcusaureus(mrsa)inlocalhospitalsinordertoprovideevidenceforclinicaldoctorstousetheantibioticsratio
4、nallyandeffectively.methodsorphismsofmrsaethodsofpcrformec-associatedhypervariableregion(hvr-pcr)andrandomamplifiedpolymorphicdna(rapd).mrsastrainstypedbyhvr-pcraccordingtothelengthpolymorphismsberofdirectrepeatunitelements(drus)ofhvr-pcrproducts;groupingofmrsabyrapdongdifferentmrsaisolates.resultst
5、otally31mrsastrainstypedbyhvr-pcrrsastrainsostpredominant,presentin11/31cases(35.48%).amongthe31mrsastrainstypedbyhvr-pcr,only1shorsastrains.thedominanttypeilardistribution.conclusionrapdandhvr-pcrmethodsnotalsopossessagoodabilitytoobtaininterpretableresults,butalsoaresimple,stable,reliableandrapid.
6、theybothhaveperfectpracticalityandprospectofextensiveapplication. keyethicillin-resistantstaphylococcusaureus;mecagene;randomamplifiedpolymorphicdna;pcrforthemec-associatedhypervariableregion 葡萄球菌的分型方法很多,传统的分型方法包括血清学分型、抗生素分型等,但均无法满足精确辨别的要求。分子生物学技术的出现为这一领域带来了革命。目前,分子分型方法已成为研究细菌耐药性发生及传播的重要手段,常见的有:脉冲
7、场凝胶电泳(pulsed-fielgelelectrophoresis,pfge),随机扩增dna多态性(randomamplifiedpolymorphicdna,rapd),meca基因高变区长度多态性(pcrforthemec-associatedhypervariableregion,hvr-pcr),荧光扩增片段长度多态性(fluorescentamplifiedfragmentleng
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