分支杆菌鉴定方法的比较研究

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1、分支杆菌鉴定方法的比较研究  材料与方法:试验菌株:(1)标准菌株:结核分支杆菌H37RV、牛分支杆菌、鸟分支杆菌、胞内分支杆菌、堪萨斯分支杆菌、瘰疬分支杆菌、偶然分支杆菌和耻垢分支杆菌标准株,均购自北京结核病胸部肿瘤研究所。(2)临床分离株:来自我院结核病住院患者的痰、胸液和脑脊液。  传统分型鉴定试验:(1)培养鉴定试验:按常规制备对硝基苯甲酸(PNB)和噻吩-2-羧酸肼(TCH)培养基,取试验菌株菌悬液(10-2/ml)0.1ml接种,37℃培养,4周看结果。(2)生化试验:68℃耐热过氧化氢酶试验、硝酸还原试验和吐温80水解试验,均按常规操作。  微菌落观察法:取试验菌株在37℃培

2、养2~3周的斜面生长物,用无菌生理盐水配制相当于10-3mg湿菌/ml接种液,取0.1ml接种匡氏琼脂平皿3个,涂匀后置36℃含5%CO2的温箱培养3、7、12d后分别在100倍显微镜下观察微菌形态,记录结果。  多重PCR鉴定法:多重PCR的三对引物是:MT1和MT2、PT1和PT2、IS5和IS6,它们分别扩增表达32000蛋白的基因序列[1]、MTP40蛋白的基因序列[2]和IS6110插入序列[3]。DNA扩增采用的PCR仪为英国Techne公司产品,型号为GeneE,操作见参考文献[4]。  结果与讨论 三种菌种鉴定法用于分支杆菌鉴定所耗时间见表1。表1 三种方法用于200株分支

3、杆菌鉴别耗用时间比较鉴别方法鉴别内容平均耗时(d)传统法结核、牛分支杆菌与非结核分支杆菌28微菌落观察法结核菌群与非结核分支杆菌7.8多重PCR法结核、牛分支杆菌与非结核分支杆菌2~3表2 三种方法用于分支杆菌菌型鉴别的结果比较方 法   受试菌株数正确鉴别菌株数%传统法20019396.5微菌落观察法20019497.0多重PCR法20019698.0  注:经χ2检验,三种方法鉴别正确率比较P>0.05  三种方法用于200株分支杆菌鉴定结果见表2。200株受试菌株中,有非结核分支杆菌11株,牛分支杆菌2株,其余187株均为结核分支杆菌,其中非结核分支杆菌株占5.5%。采用传统鉴定法,

4、有4株结核分支杆菌株和2株非结核分支杆菌菌株鉴别不明确。微菌落法鉴别错误的有4株,其中2株由于平皿上有杂菌污染而错误地鉴定为非结核分支杆菌菌株。故在操作过程中严防杂菌污染,对提高微菌落法鉴定分支杆菌的准确率具有重要意义。多重PCR扩增分支杆菌DNA时产生1~3条带,其中引物MT1-MT2扩增一条500bp的分支杆菌属特异DNA片段;引物IS5-IS6扩增一条1000bp长的结核分支杆菌菌群特异DNA带;引物PT1-PT2扩增一条约400bp的结核分支杆菌种特异片段。扩增产物电泳后,结核分支杆菌DNA标本产生3条带,牛分支杆菌DNA标本产生2条带,非结核分支杆菌DNA标本产生1条带。影响多重

5、PCR鉴定分支杆菌效果的主要因素是复性温度和Taq酶质量。多重PCR法复性温度为71℃,与延伸温度只差1℃,必须很准确。表1结果表明,采用传统法鉴定分支杆菌需28d,与微菌落法和多重PCR法相比差异有非常显著性(P<0.001);微菌落法需7.8d,与多重PCR法相比差异有显著性(P<0.01)。三种方法相比,多重PCR法用于分支杆菌菌种鉴定所耗时间最短,其次是微菌落法,传统法耗时最长。表2结果表明,三种方法用于分支杆菌菌种鉴定的正确率差异无显著性(P>0.05)。本研究提示,微菌落法和多重PCR法对分支杆菌菌种鉴定具有快速、准确的优点,较传统法更能满足结核病临床的需要。参考文献  1.B

6、orremansM,deycobacteriumtuberculosis.InfectImmun,1989,57:3123-3130.  2.ParraCA,LondonoLP,DelPortilloP,etal.Characterizationandmolecularcloningofaspecies-specificsequence.InfectImmun,1991,59:3411-3417.  3.ThierryD,Brisson-NoelA,Vincent-Levy-FrebaultV,etal.CharacteristicofaMycobacteriumtuberculosisi

7、nsertionsequence,IS6110,anditsapplicationindiagnosis.JClinMicrobiol,1990,28:2668-2673.  4.DelPatriciaP,ThomasMC,MartineE,etal.MultiprimerPCRsystemfordifferentialidentificationofMycobacteriainclinicalsamples.JClin

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