芽胞杆菌种类脂肪酸鉴定与分子鉴定方法的比较

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1、目录芽胞杆菌种类脂肪酸鉴定与分子鉴定方法的比较1福建茶园土壤菊酯类农药调查13柑橘木虱成虫过冷却点及结冰点的测定(1月份)19不同致病性青枯雷尔氏菌发酵液紫外扫描23短短芽孢杆菌FJAT-0809-GLX的基因预测及基因注释28酶解后BT、BTA与小菜蛾BBMVs的相互作用的研究34漳州香蕉枯萎病株体内细胞壁降解酶的比较40第14卷2012第2期47芽胞杆菌种类脂肪酸鉴定与分子鉴定方法的比较刘国红1，2，林营志1,刘波资助项目：国家948项目子专题：高效新型微生物资源引进与创新（2011-G25）；福建省科技项目公益专项：生物农药

2、行业特色芽孢杆菌资源库的建立及生防菌株的筛选应用（2009R10037-1）；作者简介：刘国红，博士生，研究方向为微生物分类。E-mail:liuguohong624@sina.com通讯作者：刘波，博士、研究员，从事生物技术与生物农药研究。电话：0591-87864601；E-mail:liubofaas@163.com收稿日期：；接受日期：；修回日期：（1福建省农业科学院农业生物资源研究所，350003；2福建农林大学,350002）摘要：芽胞杆菌在自然界中分布广泛，因此芽胞杆菌也具有悠久的研究历史，但是其分类地位一直处于变化

3、之中。为了寻找一种简单快速的分类手段，本文基于ITS序列和脂肪酸鉴定方法对从土壤中分离得到的16株芽胞杆菌进行分类研究，与分子鉴定结果相比，脂肪酸种的鉴定准确率可达到99%以上。通过生物软件SPSS和Mega分别对16株菌进行聚类分析，结果表明脂肪酸比ITS更适合于芽胞杆菌的分类研究，本根据脂肪酸成分可以将16株芽胞杆菌准确的聚在一起，而ITS则不能。芽胞杆菌特征性脂肪酸为15:0ANTEISO和15:0ISO，但不同种芽胞杆菌的此类脂肪酸含量不同。本文选取芽胞杆菌三大类菌群主要特征性脂肪酸的含量比例（15:0ISO/15:0AN

4、TEISO）进行了分析。其中比较特殊的为蜡状芽胞杆菌类群，蜡状芽胞杆菌主要脂肪酸为15:0ISO，其次为13:0ISO，而15:0ANTEISO的含量很低非主要类型，15:0ISO/15:0ANTEISO的比值约为5.6-7.9。简单芽胞杆菌群主要脂肪酸为15:0ANTEISO和15:0ISO，15:0ISO/15:0ANTEISO比值约为1/6左右。巨大芽胞杆菌类群主要脂肪酸15:0ISO和15:0ANTEISO含量相近，其余脂肪酸远远低于这两种主要脂肪酸。巨大芽胞杆菌的15:0ISO/15:0ANTEISO的比值为约4/5-5

5、/4，菌株4500为短小芽胞杆菌，其15:0ISO/15:0ANTEISO比值约为2。短小芽胞杆菌和巨大芽胞杆菌脂归为一类是因为其脂肪酸类型相近，但含量并不同。枯草芽胞杆菌群主要脂肪酸15:0ISO的含量小于15:0ANTEISO，15:0ISO/15:0ANTEISO的比值为1/3-2/3。综上所述，根据以上所述，芽胞杆菌主要脂肪酸含量和类型可以快速地初步判断未知菌株属于哪个类群，表明脂肪酸鉴定可以成为一种快速、有效、简单的芽胞杆菌分类鉴定方法。关键词：芽胞杆菌；脂肪酸类型；ITS序列；分类ComparisonofBacillu

6、sspeciesidentificationbasedonITSandfattyacidanalysisGuohongLiu1,2,YingzhiLin1,BoLiu1（1FujianAcademyofAgriculturalSciences,35003;2FujianAgricultureandForestryUniversity,350002）Abstract:Bacillusspeciesarewidelydistributedinnature.AlthoughthestudyofgenusBacillushasalongh

7、istory,itstaxonomicstatushasbeeninchanges.Inordertofindoutasimpleandrapidmeansforidentification,16strainsofBacillusspeciesisolatedfromsoilwerestudiedbasedonITSsequencesandfattyacidsanalysis.FAIdentificationresultsaccuracyratewas99%.ThroughbiologicalsoftwareofSPSSandMe

8、gaclusteranalysis,fattyacidswerefoundtobebetterforBacillusidentificationthanITSsequences.Inthispaper,wecouldmakeallthestrain