聚酰胺抑制基因转录研究进展

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1、聚酰胺抑制基因转录研究进展【摘要】  聚酰胺(polyamide)是一类人工合成的小分子,能以序列特异性与DNA小沟结合,从而干扰天然转录因子与特定DNA序列的结合,实现对特定基因表达的调控。此类小分子发展迅速,近年来与烷化剂连接而提出了基因沉默新途径,具有特异基因治疗的潜力。本文总结了聚酰胺对特定基因转录抑制的研究进展。【关键词】聚酰胺 启动子 基因转录;转录因子  SuppressionofGeneTranscriptionbyPolyamide——Revieideisasyntheticsmallmoleculethatrecogniz

2、espredeterminedsequencesintheminorgrooveofDNAidecansuppressgenetranscriptionbyinterferingentofnaturaltranscriptionfactorsandDNA.Thealkylatingpolyamidesrepresentanovelapproachforsequencespecificgenesilencing,ightbeappliedtogenetherapy.Theresearchonsuppressionofgenetranscrip

3、tionbypolyamideide;promoter;genetranscription;transcriptionfactor真核生物基因表达最重要的环节是转录水平的调控,人工合成的能够与DNA序列识别和结合的小分子成为化学、分子生物学及医学等领域关注的焦点之一。继DNA、RNA反义技术和RNA干扰(RNAi)技术之后,能够识别DNA序列的聚酰胺(polyamide)分子的研究十分引人注目[1]。聚酰胺是人工合成的小分子,由芳环通过酰胺键连接而成。已经发现,这些小分子不仅具有识别DNA碱基的序列选择性,还有易穿透细胞膜的功能[2,3]。最

4、近报道的一些实验表明,聚酰胺成功地抑制了一些基因的转录,尤其是人类免疫缺陷病毒(HIV)基因和一些肿瘤基因的转录,具有特异性基因治疗的潜力。聚酰胺化学结构及其与DNA的识别最初的发现是从抗肿瘤抗生素“偏端霉素”开始的,这是自然界存在的识别DNA的天然小分子,能够与DNA小沟(尤其是AT富集区)结合。受此结构启发,Gottefeld及一些研究者[3-7]合成了一些ImPyPyDp分子(Im=N甲基咪唑;Py=N甲基吡咯;Dp=N,N二甲基丙胺),合成的两个聚酰胺分子平面相对,与DNA小沟呈反向平行状态,每个聚酰胺分子上的酰胺键分别与相邻的

5、DNA碱基形成氢键,结合在DNA的DR1)编码的糖蛋白参与肿瘤细胞对多种化疗药物产生耐药的机制。MDR1基因启动子中也含有ICB,核因子Y结合到ICB并不影响糖蛋白的基础表达水平,但是可以上调化疗药物诱导的MDR1基因的转录。所有的ICBs都是相同的,但是其侧翼却有区别。如果设计合适的聚酰胺分子,干扰核因子Y与启动子ICB的结合,将有可能成为抗肿瘤药物和基因调节药物的一种新方法。拓扑异构酶Ⅱa启动子ICB2和ICB3的3’侧翼是相似的(5′ATTGGTT3′),Henry等[13]合成了针对5′TTGGT3′的聚酰胺JH37,凝胶迁

6、移率和DNaseI足迹试验表明,JH37优先与ICB2和ICB3结合,并且JH37具有较好的细胞摄取率。MDR1启动子ICB及其侧翼序列:5′ATTGGCT3′(下划线处为ICB),Buchmueller等[14]设计了聚酰胺分子ZT65B,靶序列为5′(A/T)GGC(A/T)3′,该序列也在拓扑异构酶Ⅱa启动子ICB1和ICB5的3′侧翼出现,分别是ATTGGCT和ATTGGCA(下划线处为ZT65B靶序列)。ZT65B能够以较高亲和力与MDR1启动子ICB结合,还能与拓扑异构酶Ⅱa启动子ICB1和ICB5结合,但是不能与IC

7、B2、ICB3或ICB4结合。ZT65B和JH37可以作为构建新型聚酰胺分子的原型,特异性结合具有ICB的基因,影响一种或几种蛋白的表达。体外细胞培养实验无细胞条件下的DNA模型实验表明,聚酰胺能够抑制特定基因的转录,继之人们又开始了对细胞培养体系的观察。HIV1增强子/启动子中有多种转录因子(TBP、ETS1和LEF1等)的识别序列,Dickinson等[15]合成了分别与HIV1基因TATA盒、LEF1元件和ETS1元件侧翼序列匹配和错配的聚酰胺,结果发现匹配的聚酰胺能够抑制转录因子与靶序列结合,进而抑制RNA聚合酶Ⅱ的转录

8、,而错配的聚酰胺没有上述效应;联合应用多个匹配的聚酰胺可以阻断病毒的转录和复制。某种聚酰胺能够进入人类T细胞白血病病毒1(HTLV1)感染的T细胞,与细胞核内H

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