大肠杆菌srna的研究进展

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1、大肠杆菌sRNA的研究进展　　1sRNA的发现　　1967年，通过对大肠杆菌体内所有的RNA进行标记，在聚丙烯酰胺凝胶上探测到一种数量较多的新RNA分子，从而使大肠杆菌的第一个sRNA6SRNA[2]被发现，随后又相继发现了11个sRNA，其中RprA，MicF，DicF，和DsrA是作为基因片段被发现的;GcvB和OxyS是探查基因时偶然发现的，而Spot42，10Sa(tmRNA)和10Sb等是通过磷酸化标记所有的RNA后被发现的(现在被称为M1，是RNA酶P的RNA元件)[37]。但是他们的生理功能直到30年后才被阐明。原核生物的s

2、RNA长度一般在50～250nt之间，长于真核生物中成熟的miRNA，它们在细胞中通常不被翻译，而是作为重要的调控因子参与原核生物基因的转录和翻译调控及其RNA的稳定、成熟和加工等多个过程。　　2识别sRNA的方法　　由于sRNA通过实验性探查或传统序列分析的方法很难检测到，因此尽管我们已知这些RNA分子对生物体的生理功能具有重要作用，但实际上许多的sRNA分子都是在研究个别基因系统时被偶然发现的[8]。近年来随着systematicputational，microarray和cloningbased新技术的应用，新的sRNA分子不断被发现

3、，至今在大肠杆菌体内已发现了超过百余种的sRNA分子[9]。　　2.1systematicputational法　　大肠杆菌完整基因序列的获得，使得通过系统搜寻在其基因序列中寻找sRNA的编码基因成为可能[10]。由于sRNA不翻译且仅依据二级结构就将非编码的RNA分子从随机序列中分离出来不够精确，因此采用putational法识别sRNA时要参考一些已知的sRNA基因序列特征。通过对已知sRNA分子编码基因序列分析发现，sRNA分子的基因位点主要存在于称为“empty”的基因间区，此位点没有其他　　的　　5sRNA的研究动向及展望　　5.1

4、sRNA的应用对于某些细菌，基因敲除是一种耗时的过程，RNAi技术是一种很有用的介导同源基因表达沉默的工具，而sRNA的研究为RNAi的应用提供了依据和思路，相信在不久的将来人们会广泛运用到基因治疗、基因沉默、有目的的基因表达调控上。　　5.2研究动向及有待解决的问题随着研究的深入和越来越多sRNA的发现必将使原核生物基因调控的研究进入新的空间，sRNA作为调控基因表达的重要调节子必将成为研究的热点。然而还有很多问题有待解决。不同微生物体内的sRNA是否具有差异?是否具有不同的分工?sRNA还有什么新的功能?虽然已知sRNA通过碱基配对或模拟

5、二级结构调节mRNA的稳定性或翻译，但许多细节仍然未知。如Hfq可结合sRNA也可与靶mRNA结合但是否Hfq的结合是所有配对所必需的呢?此外，RNA与Hfq结合的位点仍存在争议，是何种机制提升了sRNA与其靶的相互作用也还没有完全阐明。【参考文献】　　1HuangHY，ChangHY，ChouCH，etal.sRNAMap:genomicmapsforsmallnoncodingRNAs，theirregulatorsandtheirtargetsinmicrobialgenomes[J].NucleicAcidsRes,2009,37:

6、150154　　2HindleyJ.Fractionationof32Plabelledribonucleicacidsonpolyacrylamidegelsandtheircharacterizationbyfingerprinting[J].JMolBiol，1967，30(1):125136　　3，StrozG.6SRNAregulatesE.coliRNApolymeraseactivity[J].Cell，2000，101:613623　　4UrbanoalluntranslatedRNAinvolvedinexpress

7、ionofthedipeptideandoligopeptidetransportsystemsinEscherichiacoli[J].MolMicrobiol，2000，37(4):856868　　5MajdalaniN，ChenS，MurroallRNA:thecharacterizationofRprA[J].MolMicrobiol,2001，39(5):138294　　6AltuviaS，icrobiol,2007,10(3):25761　　9VogelJ，SharmaCM.HoallnoncodingRNAsinbact

8、eria[J].BiolChem,2005,386(12):12191238　　10LivnyJ，FogelMA，DavisBM，etal.sRNAPredict