赤桉act1和act2基因的克隆与生物信息学分析

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1、热带亚热带植物学报　2014，22(3)：242~249JournalofTropicalandSubtropicalBotany赤桉ACT1和ACT2基因的克隆与生物信息学分析1211*陈鸿鹏,朱凤云,吴志华,谢耀坚(1.国家林业局桉树研究开发中心，广东湛江524022；2.黄淮学院生物工程系，河南驻马店463000)摘要：为了解赤桉(Eucalyptuscamaldulensis)肌动蛋白(Actin)在生长发育过程中的功能，根据赤桉幼苗转录组数据库中的肌动蛋白基因序列，从赤桉嫩叶中克隆了2条Actin基因片段，并利用RACE技术获得A

2、ctin基因的全长cDNA，分别命名为EC-ACT1和EC-ACT2基因。生物信息学分析表明，这两条基因的全长cDNA分别为1533bp和1387bp，均含有1个编码377个氨基酸的开放阅读框。经比对分析，赤桉Actin蛋白的氨基酸序列与其他植物Actin蛋白的具有较高的相似性，并且具有Actin蛋白特有的保守序列和相关特征。因此推测这两条基因对桉树的生长发育具有一定的调控作用。关键词：赤桉；Actin基因；克隆；生物信息学分析doi:10.3969/j.issn.1005–3395.2014.03.005CloningandBioinfo

3、rmaticsAnalysisofACT1andACT2GenesfromEucalyptuscamaldulensis1211*CHENHong-peng,ZHUFeng-yun,WUZhi-hua,XIEYao-jian(1.ChinaEucalyptResearchCenter,Zhanjiang524022,China;2.DepartmentofBiologicalEngineering,HuanghuaiUniversity,Zhumadian463000,China)Abstract:Inordertorevealthebio

4、logicalfunctionofActiningrowthanddevelopmentofEucalyptuscamaldulensis,twofragmentswereclonedfromthetranscriptomedatabaseofE.camaldulensisseedlingsatdifferentdevelopmentalstages,namedasEC-ACT1andEC-ACT2,andtheirfull-lengthcDNAwereobtainedbyRACEmethod.Bioin-formaticsanalysis

5、showedthatthefull-lengthcDNAofEC-ACT1andEC-ACT2were1533bpand1387bp,respectively,andbothwith1131bpORFencoding377aminoacids.TheaminoacidsequenceofActininE.camaldulensishadhighsimilaritytothoseofotherplantswithtypicalconserveddomainsofActin.Therefore,theEC-ACT1andEC-ACT2genes

6、mightplayaroleinregulatinggrowthanddevelopmentofE.camaldulensis.Keywords:Eucalyptuscamaldulensis;Actin;Clone;Bioinformaticsanalysis[8–10]肌动蛋白(Actin)是构成细胞骨架的主要成分，花粉的不育和自交不亲和有关。目前，在拟南普遍存在于真核生物中，对于生物的形态、组织结芥(Arabidopsisthaliana)、水稻(Oryzasativa)、杨树[1–2]构和生长起着重要作用。同时，植物肌动蛋白(Pop

7、ulustrichocarpa)、棉花(Gossypiumhirsutum)、茶[11][12]还与信号转导、细胞器运动和定位、细胞分裂、细树(Camelliasinensis)、花生(Arachishypogaea)、[13]胞形状、细胞壁的沉积、细胞伸长、顶端生长、生长木薯(Manihotesculenta)以及蚊子(Anophelesgam-[3–7][14][15]素的极性运输等生命活动有关，甚至还与雄蕊biae)和对虾(Penaeusvannamei)中均报道存收稿日期：2013–07–31接受日期：2013–11–23基金项目：

8、广东省林业科技创新专项基金项目(2011KJCX019)；桉树生态经营及产业升级关键技术研究项目(201104003)；湛江市科技计划项　目(2013A03016)；湛江市科技计