菜豆种质资源的issr分析及特异性标记的筛选

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1、吉林农业科学2014,39（2）：28-32,50JournalofJilinAgriculturalSciences文章编号：1003-8701(2014)02-0028-05菜豆种质资源的ISSR分析及特异性标记的筛选杨晶，张金鹏，张晓旭，毛伟东，张广臣*(吉林农业大学园艺学院，长春130118)摘要：采用ISSR分子标记技术对吉林省各科研院所近年审定和主栽的36份菜豆种质的遗传多样性进行研究。从100个引物中筛选出可扩增出清晰稳定条带、重复性好的20个引物对36个菜豆品种的基因组DNA进行PCR扩增。采用NTSYS

2、pc2.10软件计算遗传相似系数，利用UPGMA方法进行聚类分析。结果表明：20个引物共扩增出87条带，其中多态性谱带76条，多态性比率为87.36%，多态性较高。36个品种间遗传相似系数在0.65~0.89之间。利用UPGMA法可将供试菜豆分为4大类，聚类结果显示，菜豆种质资源间的亲缘关系与来源地的相关性较为紧密，20号菜豆与其他品种的遗传距离相对较远。引物840为20号品种的特异性标记，在1100bp处多出一条谱带；引物861为27号品种的特异性标记，在1000bp处有一条谱带缺失；引物846为31号品种的特异性标记

3、，在1050bp处有一条谱带缺失。3个引物针对20、27、31号品种的特异性标记可将3个品种快速从所有供试的36个菜豆品种中鉴别出来。关键词：菜豆；ISSR；亲缘关系；遗传多样性中图分类号：S643.1文献标识码：AAnalysisofCommonBeanGermplasmsUsingISSRandScreeningofSpecificMarkersYANGJing,ZHANGJing-peng,ZHANGXiao-xu,MAOWei-dong,ZHANGGuang-chen*(CollegeofHorticulture

4、,JilinAgriculturalUniversity,Changchun130118，China)Abstract:ISSRmarkerwasusedtoidentifythegeneticdiversityandrelationshipof36commonbeancultivarscollectedfromthescientificresearchinstitutesinJilinProvince.20primerswerescreenedoutfromthe100ISSRprimers.Thegeneticsim

5、ilaritycoefficientswerecalculatedwithNTSYSpc2.10andtheclusteranalysiswasconductedbyUPGMA.Theresultsshowedthat87DNAfragmentswereamplifiedbyPCR,a-mongwhich76oneswerepolymorphicandthepolymorphismfrequencywas87.36%.Theresultsshowedthattherewasrelativelyhighgeneticdiv

6、ersityamongtheaccessions.Thevaluesofgeneticsimilaritycoefficientsamongtheaccessionswerebetween0.65and0.89.The36commonbeanaccessionsweredividedintofourgroupsbyUPGMA,theclusteranalysisconductedwithUPGMAshowedthattheclusteringresultswerecloselycorrelatedwiththesourc

7、eofcommonbeanandthegeneticdistancebetweencultivarNo.20andothercultivarswasrelativelyremote.ThespecificmakersofcultivarNo.20basedonprimer840amplifiedanextrabandin1100bp,thespecificmakersofcultivarNo.27basedonprimer861amplifiedanabsentbandin1000bp,andthespecificmak

8、ersofcultivarNo.30basedonprimer846amplifiedanabsentbandin1050bp.3specificmakerscouldquicklyidentifycultivarno.20,No.27andNo.31fromallthe36commonbeanvarieties.K