菜豆种质资源的ISSR分析及特异性标记的筛选-论文.pdf

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1、吉林农业科学2014,39(2):28—32,50JournalofJilinAgriculturalSciences文章编号:1003—8701f2014)02—0028—05菜豆种质资源的ISSR分析及特异性标记的筛选杨晶,张金鹏,张晓旭,毛伟东,张广臣木(吉林农业大学园艺学院,长春130118)摘要:采用ISSR分子标记技术对吉林省各科研院所近年审定和主栽的36份菜豆种质的遗传多样性进行研究。从100个引物中筛选出可扩增出清晰稳定条带、重复性好的2O个引物对36个菜豆品种的基因组DNA进行PCR扩增。采用

2、NTSYSpc2.10软件计算遗传相似系数,利用UPGMA方法进行聚类分析。结果表明:20个引物共扩增出87条带,其中多态性谱带76条,多态性比率为87.36%,多态性较高。36个品种间遗传相似系数在0.65~0.89之间。利用UPGMA法可将供试菜豆分为4大类,聚类结果显示,菜豆种质资源间的亲缘关系与来源地的相关性较为紧密,20号菜豆与其他品种的遗传距离相对较远。引物840为20号品种的特异性标记,在1100bp处多出一条谱带;引物861为27号品种的特异性标记,在1000bp处有一条谱带缺失;引物846为3

3、1号品种的特异性标记,在1050bp处有一条谱带缺失。3个引物针对20、27、31号品种的特异性标记可将3个品种快速从所有供试的36个菜豆品种中鉴别出来。关键词:菜豆;ISSR;亲缘关系;遗传多样性中图分类号:$643.1文献标识码:AAnalysisofCommonBeanGermplasmsUsingISSRandScreeningofSpecificMarkersYANGJing,ZHANGJing-peng,ZHANGXiao-xu,MAOWei-dong,ZHANGGuang-chen(College

4、ofHorticuhure,JilinAgriculturalUniversity,Changchun1301l8,China)Abstract:ISSRmarkerwasusedtoidentifythegeneticdiversityandrelationshipof36commonbeancuhivarscollectedfromthescientificresearchinstitutesinJilinProvince.20primerswerescreenedoutfromthe100ISSRprim

5、ers.ThegeneticsimilaritycoeficientswerecalculatedwithNTSYSpc2.10andtheclusteranalysiswasconductedbyUPGMA.Theresultsshowedthat87DNAfragmentswereamplifiedbyPCR.a—mongwhich76oneswerepolymorphicandthepolymorphismfrequencywas87.36%.Theresultsshowedthattherewasrel

6、ativelyhighgeneticdiversityamongtheaccessions.Thevaluesofgeneticsimilaritycoefficientsamongtheaccessionswerebetween0.65and0.89.The36commonbeanaccessionsweredividedintofourgroupsbyUPGMA,theclusteranalysisconductedwithUPGMAshowedthattheclusteringresultswereclo

7、selycorrelatedwiththesourceofcommonbeanandthegeneticdistancebetweencuhivarNo.20andothercuhivarswasrelativelyremote.ThespecificmakersofcuhivarNO.2Obasedonprimer840amplifiedanextrabandin1100bp.thespecificmakersofcultivarNo-27basedonprimer86lamplifiedanabsentba

8、ndin1000bp.andthespecificmakersofcuhivarNo-30basedonprimer846amplifiedanabsentbandin1050bp.3specificmakerscouldquicklyidentifycuhivarno.20.NO.27andNO.31fromallthe36commonbeanvarieties.Keywords:C

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