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1、第43卷第1期广西林业科学Vol.43No.12014年3月GuangxiForestryScienceMar.2014文章编号:1006-1126-2014(1)-0069-06平菇DNA不同提取方法比较陈国明,魏海莲,李志强,杨丛志,何德,李翠新(西南林业大学生命科学学院,昆明650224)摘要:以野外采集的平菇为样本,经菌丝培养后,用FDEB法、FDEB-CTAB法、改良CTAB法和改良SDS法提取DNA,并进行琼脂糖凝胶电泳检测、紫外分光光度计分析和标准差及标准误分析,结果表明:FDEB法提取的平菇DNA产率最高,但存在较严重RNA的污染,标准差和标准误比较大,稳定性差
2、;改良CTAB法综合效果不错,提取稳定性高;改良SDS法提取的平菇DNA的纯度最好,标准差和标准误最低,提取效果稳定性最好,但产量相对较低;FDEB-CTAB法提取平菇DNA,去多糖的效果很好,标准差和标准误适中,但产量较低。综合以上结果,改良CTAB法提取蘑菇DNA综合效果最好。关键词:平菇菌丝体;DNA提取;FDEB法;FDEB-CTAB法;改良CTAB法;改良SDS法中图分类号:S789文献标识码:AComparisonofDifferentMethodstoExtractGenomicDNAfromPleurotusostreatusCHENGuo-ming,WEIHa
3、i-lian,LIZhi-qiang,YANGCong-zhi,HEDe,LICui-xin(CollegeofLifeScience,SouthwestForestryUniversity,Kunming650224,China)Abstract:BymyceliumcultureofwildPleurotusostreatus,itsgenomicDNAwasextractedbyfourmeth-ods,whichweretheFDEB,FDEB-CTAB,modifiedCTABandimprovedSDS,whichwasanalyzedbyagarosegelele
4、ctrophoresis,ultravioletspectrophotometer,andstandarddeviationandstandarderrorofa-rithmeticmean.TheresultsshowedthattheyieldofDNAbyFDEBwasthehighestamongfourmethods.ButtherewassevereRNApollution,andthechangeofstandarddeviationandstandarderrorappearedafewfluctuations.TheDNAqualitybythemodifie
5、dCTABwasobviouslybetterandstable.ThepurityofDNAbytheimprovedSDSwasthehighestandchangeofstandarddeviationandstandarderrorwasthelowest.Whereasitsyieldwasrelativelylow.ThepolysaccharidepollutioncouldberemovedeffectivelybyFDEB-CTABmethod,whosechangeofstandarddeviationandstandarderrorwasmoderate.
6、Butyieldwasverylow.SothemodifiedCTABwasthebestmethodforextractinggenomicDNAfromPleurotusos-treatus.Keywords:Pleurotusostreatusmycelium;DNAextraction;FDEB;FDEB-CTAB;modifiedCTAB;improvedSDS收稿日期:2014-01-03基金项目:云南省优势特色重点学科生物学一级学科建设项目(50097505);西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室开放基金项目(KL200707);云南省高校特色专业建设点项
7、目(50116001);西南林业大学科研启动基金(111046)作者简介:陈国明(1989—),男,硕士研究生,研究方向:生物化学与分子生物学。通讯作者:李翠新,女,博士,副教授,研究方向:食用菌学;何德,男,博士,副教授,研究方向:分子细胞生物学。70广西林业科学第43卷1953年沃森(Watson)和克里克(Crick)发以预冷的研棒用力研磨至粉末状;(3)迅速把粉现DNA双螺旋模型后,分子生物学进入了蓬勃发末转入1.5mL的离心管中,并马上加入600μL预[1]展的时期,开辟了生命科学
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