SELDI—TOF／MS分析原发性肝癌TACE治疗前后血清蛋白质差异表达谱-论文.pdf

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1、第24卷第5期中国现代医学杂志Vo1．24No．52014年2月ChinaJournalofModernMedicineFer．2014文章编号：1005—8982(2014)05-005l一05·临床论著·SELDI—TOF／MS分析原发性肝癌TACE治疗前后血清蛋白质差异表达谱水齐义军，马瑾，张天，王明，晁玮霞，朱晗，刘瑞敏，马远方，PhilipJohnsonz(1．河南大学医学院细胞与分子免疫学重点实验室，河南开封475004；2．英国伯明翰大学，B152TT)摘要：目的分析原发性肝癌患者经导管肝

2、动脉化疗栓塞(TACE)治疗后血清蛋白质指纹图谱的变化。方法应用SELDI—TOF／MS技术和IMAC30蛋白质芯片采集50例肝癌患者TACE治疗前后肝癌患者的血清蛋白质质谱，BiomarkerWizard软件分析差异表达蛋白质峰，应用支持向量机(supportvectormachine，SVM)建立TACE治疗前后分类模型，ROC评价各差异蛋白质峰和SVM分类模型的分类效率。结果在0～20000m／z质荷比范围内，共采集到199个蛋白质峰，BiomarkerWizard软件鉴定出13个差异表达蛋白质峰

3、(P<0．05)，包括TACE治疗24h后7个高表达蛋白质峰和6个低表达蛋白质峰。2883、11535和11687等3个蛋白质峰区分TACE治疗前后HCC的敏感性和特异性分别为80％、76％、62％和80％、60％、62％，AUC为0．8；SVM分类模型区分TACE治疗前后HCC的敏感性和特异性均为100％。结论应用SELDI—TOF／MS技术可分析TACE治疗后血清差异表达蛋白质谱，SVM分类模型能有效区分TACE治疗前后HCC。关键词：原发性肝癌；SELDI-TOF／MS；蛋白质芯片；经导管肝动脉化

4、疗栓塞中图分类号：R735．7文献标志码：ASerumproteomefingerprinting0fhepat0cellularcarcinomaafterTACEtreatmentusingSELDI-TOF／MSQIYi-jun，MAJin，ZHANGTian，WANGMing，CHAOWei-xia，ZHUHan，LIURui-min，MAYuan-fang，PhilipJohnsonf1．KeyLaboratoryofCellularandMolecularImmunology,Medical

5、SchoolofHenanUniversity,Kaifeng,Henan475004,P．R．China；2．UniversityofBirmingham,B152TT,UK)Abstract：【Objective】TofingerprintseHJmproteomeofhepatocellularcarcinoma(HCC)aftertran—scathetera~efialchemoembolization(TACE)treatment．【Methods】Pairedsernmsamplesofp

6、reandpost—TACEtreatmentfor50HCCpatientsunderwentproteomefingerprintingusingIMAC30proteinchipwithsur—faceenhancedlaserdesorptionandionizationtimeofflightmassspectrometryfSELD1一TOF—MS)．TheMSspectrawereanalyzedtoidenti~differentlyexpressedproteinpeaksbyCiph

7、ergenSELDIsoftwareBiomarkerWizard3．1．1．Suppo~vectormachinefSVM1wasusedtobuildclassificationmodelusingdifferentialproteinpeaks．Receiveroperatingcharacteristic(ROC)wasusedtoevaluatetheclassificationeficiencyofindividualdifierentialpeakandSVMclassificationm

8、ode1．【Results】Atotalofonehundredandninety—nineserumproteinpeaksbetween0～20000m／zwereidentified．amongwhichthereare13differentialpeaksincluding7up—regulatedand6down-regulatedproteinpeaks24hpostTACEtreatment．Eachproteinpeakof