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时间:2020-02-29
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1、Vol.38高等学校化学学报No.12017年1月CHEMICALJOURNALOFCHINESEUNIVERSITIES1~11[综合评述]doi:10.7503/cjcu20160587MicroRNA的超灵敏检测研究进展王子月,刘萌,张春阳(山东师范大学化学化工与材料科学学院,济南250014)摘要综述了最新发展的MicroRNA(miRNA)分析方法,包括比色、荧光、化学发光、表面增强拉曼、单分子检测和电化学分析,并对miRNA检测的发展方向做了展望.关键词MicroRNA;超灵敏检测;扩增;分析
2、方法中图分类号O655文献标志码AMicroRNA(miRNA)是一类长约为22个核苷酸(nt)的内源性非编码小分子单链RNA,普遍存在于[1][2]真核细胞中.miRNA由长约70nt具有茎环结构的microRNA前体经核酸酶Dicer剪切产生.在细[3,4]胞增殖、分化和肿瘤发生时,通过RNA诱导沉默复合物(RISC)的协调作用,miRNA可以与mRNA[5]的3'端非编码区相互作用以降低靶mRNA的稳定性或抑制蛋白质翻译,从而调控靶基因的表达.自[6]Lee等在1993年首次从线虫中发现了真正意义上
3、的miRNA—lin-4以来,研究者已经确定了人类基因组中超过450种的microRNA.miRNA可以控制超过50%人类编码基因的活性,在生物发育、细胞分[7~10]化、凋亡、增殖和免疫等生物过程中发挥着至关重要的调控作用.miRNA在人体组织和血液中的[11~15]异常表达与癌症的发生、发展和治疗反应密切相关.miRNA可作为癌症诊断和预测的生物标记[16,17]物,也可作为新药物的潜在作用靶点.因此,miRNA的超灵敏检测有助于临床早期诊断与抗癌药物的研发.然而,由于miRNA片段小、在细胞中表达量
4、低和序列同源性高,致使miRNA的超灵敏检测[18]面临许多挑战.[19~21][22~25]传统的miRNA分析方法包括Northern印迹杂交法、微阵列分析法和实时定量聚合酶链[5,16,26,27]式反应(qRT-PCR)等,这些方法准确度高、应用广泛,但也存在一些不足.Northern印迹杂交法耗时费力、灵敏度低、样品需求量大,且不能用于低丰度miRNA的测定.微阵列分析方法可用于发[28][22]现新的miRNA,并且可实现miRNA的多重检测,但其灵敏度较低、特异性较差、动态范围较窄、[29]
5、[30,31]芯片制作和检测费用高且重复性差.qRT-PCR操作简单、灵敏度高,但miRNA序列较短限制[32][33]了其逆转录环节,且qRT-PCR通常需要复杂的引物设计和精确的温度控制.另外,PCR过程中[34]非特异性扩增也容易导致假阳性.近年来,发展了许多新的miRNA分析方法,显著提高了检测灵敏度.这些方法引入了生物发[35~37][38~40][41][42][43,44][45]光、酶分析、分子信标、深度测序以及基于锁核酸和桥连链式反应,但依然[35,36]存在一些无法避免的缺陷.生物发光
6、法使用生物发光蛋白Renilla荧光素酶作为标记物,操作简[39]单,但其分析原理基于发光信号的减弱.酶分析法具有信号放大效果好的优点,但特异性和灵敏度[42]相对较低.深度测序可用于快速定量分析miRNA的绝对水平,但是检测成本较高.基于锁核酸和桥[43][45]连链式反应的分析方法需要固定/分离步骤和设计复杂的DNA探针,限制了其应用.由于miRNA长度短且丰度低,需要引入信号放大来提高miRNA检测的灵敏度.研究者先后将杂交链式反应(Hybridizationchainreaction,HCR)、滚
7、环扩增(Rollingcircleamplification,RCA)及链置换[46~49][41,50~52]扩增(Stranddisplacementamplification,SDA)等扩增反应与比色分析、荧光、化学发收稿日期:2016-08-18.网络出版日期:2016-12-09.基金项目:国家杰出青年科学基金(批准号:21325523)和科技部重点领域创新团队项目(批准号:2015RA4024)资助.联系人简介:张春阳,男,博士,教授,博士生导师,主要从事单分子检测和生化分析研究.E-mail
8、:cyzhang@sdnu.edu.cn2高等学校化学学报Vol.38[53~56][57~60][61~63][64~66]光、表面增强拉曼、单分子检测和电化学分析结合起来,实现了miRNA的超灵敏检测.本文结合本课题组的工作对近年来miRNA检测方法的进展进行了较为全面的评述.1miRNA检测方法1.1比色法比色法可依据颜色变化对miRNA进行定量分析,具有操作简单、结果直观、成本低以及灵敏度高[67][68]等优点.近来
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