实时荧光PCR在治理石油污染中的应用.pdf

《实时荧光PCR在治理石油污染中的应用.pdf》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。

1、微生物学杂志2014年4月第34卷第2期JOURNALOFMICROBIOLOGYApr．2014Vo1．34No．233实时荧光PCR在治理石油污染中的应用喻婵，姚俊(北京科技大学土木与环境工程学院环境与能源国际合作基地，北京100083)摘要石油污染已成为全球最严重的环境问题之一，运用生物学方法治理石油污染逐渐成为研究热点。从大港油田原油样品中筛选到12株能降解原油的菌株，分别对其降解特性进行了研究。其中，被命名为Bs的菌株对原油的降解效果最好，降解率高达89．1％，经16SrDNA序列比对，与BacillussubtilisBSn5

2、的相似性达l00％。通过生物信息学的方法，分析菌株B．subtilisBSn5的代谢途径，该菌株中有11个基因参与石油烃类化合物的降解过程。最后利用实时荧光PCR技术，测定在石油降解过程中起重要作用的烷基羟化酶基因(alkB)在菌株BS与标准菌株口．subtilisBSn5中的表达量，结果显示，该基因在菌株Bs中的表达量较标准菌株B．subtilisBSn5高约2倍，这可能与菌株Bs的生存环境有关。为检测和分析石油污染，筛选含有降解石油功能基因的微生物及构建工程菌株提供了新的手段。关键词枯草芽胞杆菌BSn5；石油污染；代谢途径；功能基因；

3、实时荧光PCR中图分类号Q93文献标识码A文章编号1005—7021(2014)02—0033—04doi：10．3969／j．issn．1005—7021．2014．02．007ApplicationofReal-TimePCRinHarnessingOilPollutionYUChan．YAOJun(Col1．ofCivil＆EnvironmtEngin．，BeijingSci．＆Techno1．，InternIBaseofEnviromt＆Energy，Beijing100083)AbstractOilpollutionhasbee

4、noneofthemostseriousenvironmentproblemstheworldoverandbiologicalmethodshavebecomeahotspotfortheharnessingthepollutants．Inthispaper，twelveoil—degradingbacterialstrainswereiso—latedfromDagangOilFieldinTianjin，NorthChinaandstudiedtheirdegradationcharacteristics．Amongthemastr

5、ainnamedBSshowedthehighestdegradationeffectwithashighas89．1％．16SrDNAsequencecomparisonshowedthatithad100％similaritywithBacillussubtilisBSn5．MetabolicpathwaysofthestrainB．stubilisBSn5andfoundthroughbioinformatiesmethodsthattherewereabout11genesinvolveinoildegradationproces

6、s．Finallyfluo—rescentRT—PCRwasusedtoexaminetheexpressionofalkyl—hydroxylaseB(alkB)geneinBSstrainandinstandardB．subtilisBSn5．TheresultshowedthattheexpressioninBSstrainwastwofoldshigherthanthoseinstandardB．subtilisBSn5．ItmayberelatedtothehabitatenvironmentofBSstrain．Thisstu

7、dyprovidesanewmeasuretomonitorandanalyzetheoilpollution．toscreenmicrobescontainingfunctionaloil—degradationgenes，andeventoconstructtheengineeringstrainstodecomposeoil．KeywordsB．subtilisBSn5；oilpollution；metabolicpathways；functionalgenes；fluorescentRT—PCR石油烃类化合物是环境中普遍存在的一类

8、污加工、运输、处理等过程中常伴随有石油的泄漏，造染物，主要元素包括c、H、O、N、P，是由烷烃、芳成严重的石油污染。治理石油污染的方法很多，香烃、胶质及沥青组成的混合物。在石油的开采、主要包括