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时间:2020-05-15
《茄子SmWOX13基因的克隆、亚细胞定位及序列分析.pdf》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、第33卷第2期上海交通大学学报(农业科学版)Vo1.33No.22015年4月JOURNALOFSHANGHAIJIAOTONGUNIVERSITY(AGRICUITURALSCIENCE)Apr.2015文章编号:1671—9964(2015)02~0001—08DOI:10.3969/J.ISSN.1671—9964.2015.02.001Cloning,SubcellularLocalizationandSequenceAnalysisofUSCHEL—RelatedHomeobox13-LikeG
2、ene(SmWOX13)inEggplant(Solanummelongena)HANHong—qiang。LUYang,ZHOUZi—lu,LIUXin—yu,CHENHuo—ying(SchoolofAgricultureandBiology,ShanghaiJiaotongUniversity,Shanghai200240,China)Abstract:WUSCHEL—relatedhomeoboxgenesencodetheconservedtranscriptfactorfamilywhichp
3、laysasIgnificantroleinplantdevelopment.Inthisstudy,SmWOX13geneof1233bpeDNAincluding834bpcodingsequencewasclonedineggplant.Deducedaminoacidssequencewasusedtoanalyzetheconservatlonindifferentspeciesandtogeneratethe3Dstructure.Genestructurewasanalyzedbasedon
4、thegenomlcsequence,SubcellularlocalizationofthefusedSmWOX13一GFPproteindemonstratedthattheSmWOX13waslocatedincellnucleus.ThephylogenetictreeshowedSmWOX13belongstothegroupOftomatoWOX8geneandArabidopsisWOX13gene.AlltheresultsdemonstratedthatSmWOX13mightplaya
5、nimportantroleincontrollingthefruitshapeaspreviouslyreportedintomatoandArabidopsis.Keywords:SmWOX13;genecloning;subcellularlocalization;genestructure;phylogeny;eggplant茄子SmWOX13基因的克隆、亚细胞定位及序列分析韩洪强,刘杨,周子路,刘新宇,陈火英(上海交通大学农业与生物学院,上海200240)摘要:WUSCHEL—relatedho
6、meobox基因编码保守的转录因子家族在植物发育中起着非常重要的作用。本文从茄子中克隆了SmWOX13基因,该基因cDNA序列全长1233bp,包含834bp编码序列。推导氨基酸序列用于分析该基因的保守性及生成3D结构。扩增获得的基因组序列被用于该基因结构的分析。SmWOX13与GFP融合蛋白的亚细胞定位结果表明该蛋白被定位于细胞核。系统发生树显示茄子SmWOX13基因与番茄WOX8和拟南芥WOX13属于同一个分支。综上结果可表明茄子SrnWOX13基因可能与之前报道的番茄和拟南芥WOX基因类似,参与了果
7、实形状的控制。关键词:SmWOX13;基因克隆;亚细胞定位;基因结构;系统发生树;茄子中图分类号:$641.1文献标识码:AHomeobox(HB)transcriptionfactorsareapproximate60aminoacidsL一引.HBtranscriptionencodedbyhomeoboxgenes,whichcontainaclassicfactorsarefunctionallyessentialtoregulateeukaryoteDNAbindingdomain(termed
8、homeodomain)withdevelopment,whichisexemplifiedbytheprototypic收稿日期:2014—04—14基金项目:国家自然科学基金青年基金项目(31301770);国家星火(2O12GA68。0O3);上海农委项目(沪农科种字(2013)第5号)作者简介:韩洪强(1983一),男,博士,研究方向:园艺植物生物技术,E-mail:han一1983—119@163.com;陈火英(1
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