应用扩增受阻突变检测系统（ARMS）检测HBV基因型-论文.pdf

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1、中华实验和临床病毒学杂志2013年l2月第27卷第6期ChineseJExpClinVirol。December2013，vo1．27．No．6495·技术方法应用扩增受阻突变检测系统(ARMS)检测HBV基因型郑剑，朱珉之，张宏宇，朱珍，郑中伟，柳龙根，陈春华，王永忠【摘要】目的建立扩增受阻突变检测系统(ARMS)检测乙型肝炎病毒(HBV)基因型方法，并对慢性乙型肝炎(CHB)患者HBV基因型进行分析。方法通过对HBV全基因组序列比对分析，设计ARMS特异性引物和探针体系，建立检测HBVB和C基因型方法，对5O例临床标本进行检测。结

2、果50例临床样本中，B型的检出率为26％(13例)，c型为74％(37例)，其实验结果与测序结果完全一致。常州及周边地区乙型肝炎病毒c基因型HBV为优势株。C基因型患者A1762T／G1764A突变率为62％，明显高于B型。结论ARMS检测HBV基因型，快速、准确；常州及周边地区HBV基因型主要为B、C型，且C型携带A1762T／G1764A双突变率较高，与较为严重的肝病相关。【主题词】肝炎病毒，乙型；基因型；核酸扩增技术DetectionofhepatitisBvirusgenotypesbyamplificationrefract

3、orymutationsystemZHENGJian，ZHUMin—zhi，ZHANGHong—yu，ZHUZhen，ZHENGZhong—wei，LIULong—gen，CHENChun—hua，WANGy0一zhong．ChangzhouThirdPeople'sHospital，Jiangsu213001，ChinaCorrespondingauthor：WANGyo一zhong，Email：wyz213003@163．corn【Abstract】ObjeetiveToEstablishamplificationrefracto

4、rymutationsystem(ARMS)forhepatitisBvirusgenotypingassayanddetectHBVgenotypeinpatientswithchronichepatitisBbyit．MethodBasedonHBVgenomesequencealignment，wedesignedspecificprimersandprobe，establishedARMSforHBVBandCgenotypinganddetected50clinicalsampleswithchronicHBVinfecti

5、on．ResultsAmong50samples，genotypeBandCwhichweredetectedbyARMSassayis26％(14／50)and74％(37／50)separately．Theresultswerecompletelyconsistentwithsequencingresul~．GenotypeCwasmoreprevalentthangenotypeBinChangzhouarea，and62％patientswithgenotypeCcarriedA1762T／G1764Adoublemutati

6、on，muchhigherthangenotypeB．ConclusionARMSwasafastandaccurateassayforHBVgenotypedetection．DominantHBVgenotypesinChangzhouareaweregenotypesBandC．andgenotypeCcarriedmoreA1762T／G1764Adoublemutation，maybeassociatedwithmoreseverliverdisease．【Keywords】HepatitisBvirus；Genotype；

7、Nucleicacidamplificationtechnique大量的研究表明，HBV感染在临床上的表现、1对象与方法对抗病毒药物的敏感程度、预后以及抗原抗体血清转化与HBV基因型相关；C基因型HBV感染更容1．1研究对象50例标本随机采集于2012-2013易诱发严重的肝脏疾病，HBV基因分型对临床诊断年在本院就诊的患者，诊断标准符合中华医学会传和预后判断具有重要的意义。目前HBV分型的方染病与寄生虫病分会联合修订定的病毒性肝炎的诊法有RT—PCR、RFLP、基因型特异性引物PCR、HRM断标准。和测序等。我们应用扩增受阻突变检测

8、系统1．2DNA提取参照凯杰公司病毒DNA提取试(ARMS)对常州及周边地区HBV基因型进行了分剂盒操作说明(QiagenMinElutevirusspinkit)，备析，现将结果报道如下。用。1．3HBVDNA定量采用