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《乙型肝炎病毒基因型及其临床意义的研究进展-论文.pdf》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在应用文档-天天文库。
1、预防医学论坛2014年1月第2O卷第1期PreyMedTrib,Vo1.20,No.1,Jan.2014·47··综述·乙型肝炎病毒基因型及其临床意义的研究进展陈钦艳广西壮族自治区疾病预防控制中心,广西南宁530028摘要:慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染是全球性公共卫生问题,慢性HBV感染可导致不同类型的肝病,包括慢性肝炎、肝硬化和肝细胞癌。大量的研究表明,HBV基因组易发生变异,形成不同的基因型,HBV基因型具有明显的地理分布和种族分布特点,它与疾病进展和临床转归有关,不同的基因型对抗病毒治疗的应答也不完全相同,近年来国内外学者从流行病学、分子
2、生物学、临床医学开展了大量的研究,本文就国内外乙型肝炎病毒基因型及其临床意义的研究进展进行了综述。关键词:乙型肝炎病毒;基因型;临床意义中图分类号:R512.62文献标识码:A文章编号:1672—9153(2014)01—0047—03乙型肝炎病毒(HepatitisBvirus,HBV)为一嗜D4个基因型。随后其他学者根据这个原则发现E到肝细胞DNA病毒,不仅可以引起隐匿性、急性和慢性H基因型。2008年,Tran等_3报道一株复杂的HBV病毒性肝炎(Chronichepatitis,CH),还与肝硬化和肝重组株,该株与几年前Hannoun等_
3、4报道的3株异常细胞癌(Hepatoce1lu1arCarcinoma,HCC)的发生发展基因毒株高度同源,在全基因组系统进化树分析中。密切相关。虽然通过对HBV和宿主及其相互作用的Tran发现这几株单独成为一个分支,因此建议命名这研究,已经生产了有效的预防疫苗和多种抗病毒药物,几株为新的HBV基因型I。2009年,Olinger等报但HBV感染仍是世界范围内的公共健康问题。HBV道老挝也有类似的毒株,而且它们与基因型C的差异在复制过程中,容易发生核苷酸的错误配对,导致同一高达7.93,因此他们认为这些毒株属于新基因型I,病毒核苷酸序列的差异,表
4、现为HBV不同的基因型。并将这些毒株分为两个基因亚型I1和I2。2009年依据郭氏原则,微生物本身是造成疾病的一个决定因Tatematsu等[6应用巢式PCR技术在日本分离出1素,从遗传学角度而言,微生物本身基因又决定了微生株全基因,将HBV全基因克隆在DH5细胞中进行基物的众多生物行为,因此不同基因型的HBV也会有因测序,分析与其他基因型差异为11.7~15.7,不同的生物特征,如致病力或抗病毒药物的治疗反应命名J基因型。到目前为止,HBV共分为A-JlO个基等。对HBV基因变异的深入研究和深刻认识。必将因型。根据型内基因组核苷酸序列差异4,每
5、个为揭示HBV感染不同临床表现的分子机制和开发治基因型还可分出多个亚型,例如A基因亚型有A1一疗预防新策略提供依据。A7[,B基因亚型有B1一B9_8],基因亚型有C1一C16l9],D基因亚型有D1~D8l1,F基因亚型有F工a、FIb、F1HBV基因型分型Ⅱ、FⅢ和FIV[1,I基因有亚型I1和I2l_5],而E、G、HBV基因组全长3200个碱基,以部份环状双链H、和J尚未有基因亚型的报道。随着研究的进一步存在,其中负链为完整的环链,包括4个相互重叠的开深入,可能会发现更蠡的新基因型和新基因亚型。放读框(0RF),即S、C、P、X和多个基因
6、表达调控区。2HBV基因型的分型方法HBV基因组易发生变异,一方面由于HBV在复制过程中必须经过前基因组RNA(pgRNA)中间体进行逆①全基因测序分型法:是基因分型的金标准,最准转录,而负责逆转录DNA聚合酶缺乏校正功能[1],因确可靠,但费用高,耗时长,操作复杂,不利于大规模调此在逆转录过程中有很高的错配率;另一方面由于查研究;②S基因序列测定法:简化了基因分型的工序;③聚合酶链反应一限制性内切酶长度多态分析法HBV在亿万人群中长期传播,经受着巨大的免疫压(PCR—RFLP):是目前使用最多的分型法,它的原理是力,也可导致HBV变异,造成病毒
7、结构和功能的改变。1988年,日本科学家0kamoto等_2根据全基因将各种基因型的HBVS基因或前S基因序列排列后组核苷酸序列差异89/6,将18株HBV分为从A到比较,发现每种基因型有其独特的限制性内切酶位点,先经PCR扩增出目标片断,然后用特定的限制性内切作者简介:陈钦艳(1970~),女,本科,副主任技师,研究方向:乙型肝炎酶进行酶切,经酶切后产生不同的图谱,据此可区分不病毒防治同的基因型。该方法应用最广泛,操作简单,费用相对·48·预防医学论坛2014年1月第2o卷第1期PrevMedTrib,Vo1.20,No.1,Jan.2014低
8、廉,适用于大量样本测定。④多引物PCR法:设计为HBeAg阴性,G基因型较少见,单纯G基因型感染不同基因型的特异性引物,进行套式PCR,
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