关联分析及其在水稻遗传研究中的应用-论文.pdf

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1、云南农业大学学报JournalofYunnanAgriculturalUniversity，2014，http：／／xb．ynau．edu．cnISSN1004—390X；CODENYNDXAXE—mail：xb@ynau．edu．cnDOI：10．3969／j．issn．1004—390X(n)．2014．05．022关联分析及其在水稻遗传研究中的应用：I：张斐斐，杨雅云，董超，汤翠凤，阿新祥，张恩来，陈丹，徐福荣，戴陆园(云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所，云南省农业生物技术重点实验室，农业部

2、西南作物基因资源与种质创制重点实验室，农业部云南稻种资源科学观测实验站，云南昆明650223)摘要：近年来，以连锁不平衡为理论基础的关联分析被越来越广泛地应用于解析植物的数量性状，以发掘优异等位基因。本文阐述了关联分析的理论基础连锁不平衡及其影响因素和关联分析的分析策略及统计方法等，并将其与传统的基于连锁分析的QTL作图进行了比较分析，综述了其在水稻营养品质、形态与农艺性状、抗逆和抗病虫性等研究中的应用并对其今后的发展进行了展望。关键词：关联分析；连锁不平衡；水稻中图分类号：Q332；S511．032文

3、献标志码：A文章编号：1004—390X(2014)O5—0752—07AssociationMappingandItsApplicationinRiceGeneticResearchZHANGFeifei，YANGYayun，DQNGChao，TANGCuifeng，AXinxiang，ZHANGEnlai，CHENDan，XUFurong，DAILuyuan(InstituteofBiotechnologyandGermplasmResources，YunnanAcademyofAgricultur

4、eSciences，YunnanProvincialKeyLabofAgriculturalBiotechnology，KeyLabofSouthwesternCropGeneResourcesandGermplasmInnovation，MinistryofAgriculture，ScientificObservationforRiceGermplasmResourcesofYunnan，MinistryofAgriculture，Kunming650223，China)Abstract：Linkag

5、edisequilibrium·basedassociationmappinghasbeenappliedtodissecttheplantquanti-tativetraitSOastoexplorethefavorableallelesinrecentyears．Here，Wefirstbrieflyintroducedlinkagedisequilibrium，thetheoreticalbaseofassociationmapping，anditsafectingfactorsaswellast

6、hegeneralstrategyofassociationmapping，comparedthedifferencebetweenassociationmappingandthetraditionallinkage—basedQTLmapping．Theapplicationadvancementofassociationmappinginthericeresearchoftasteandquality，morphologicalcharacteristicsandagronomictraits，ab

7、ioticandbioticstresstolerancewasreviewed，theprospectoftheassociationmappinginricegeneticresearchWasalsoproposedhere．Keywords：associationmapping；linkagedisequilibrium；rice关联分析(associationanalysis)，又称连锁不联作图(associationmapping)，是一种以连锁不平衡作图(1inkagedisequilib

8、riummapping)或关平衡(1inkagedisequilibrium，LD)为基础，以自收稿日期：2013—11—12修回日期：2013—12—14网络出版时间：2014—09—1316：58基金项目：国家自然科学基金项目(31260317)；“863”计划(2010AA101805)；云南省科技创新强省计划项目(2007C0219Z)；云南省社会发展科技计划项目(2010CC009；2012CH009)；云南省人才培养项目(200