第一章蛋白质化学1

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1、第一章蛋白质化学蛋白质的生物学意义蛋白质的元素组成蛋白质的氨基酸组成肽蛋白质的结构蛋白质分子结构与功能的关系蛋白质的性质蛋白质的分类提要蛋白质是由许多不同的α-氨基酸按一定的序列通过酰胺键(肽键)缩合而成的,具有较稳定的构象并具有一定生物功能的大分子。一、蛋白质的生物学意义1.生物体的组成成分2.酶3.运输4.运动5.抗体6.干扰素7.遗传信息的控制8.细胞膜的通透性9.高等动物的记忆、识别机构二、蛋白质的元素组成C(50~55%)、H(6~8%)、O(20~23%)、N(15~18%)、S(0~4%)、…N的含量平均为16%——凯氏(Kjadehl

2、)定氮法的理论基础三、蛋白质的氨基酸组成氨基酸是蛋白质的基本组成单位。从细菌到人类,所有蛋白质都由20种标准氨基酸(20standardaminoacids)组成。(一)氨基酸的结构通式:19种氨基酸具有一级氨基(-NH3+)和羧基(-COOH)结合到α碳原子(Cα),同时结合到(Cα)上的是H原子和各种侧链(R);Pro具有二级氨基(α-亚氨基酸)不带电形式H2N—Cα—HCOOHR+H3N—Cα—HCOO-R两性离子形式Cα如是不对称C(除Gly),则:具有两种立体异构体[D-型和L-型]2.具有旋光性[左旋(-)或右旋(+)](二)氨基酸的分类

3、根据R的化学结构(1)脂肪族氨基酸:1)疏水性:Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Met、Cys;2)极性:Arg、Lys、Asp、Glu、Asn、Gln、Ser、Thr(2)芳香族氨基酸:Phe、Tyr(3)杂环氨基酸:Trp、His(4)杂环亚氨基酸:Pro根据R的极性(1)极性氨基酸:1)不带电:Ser、Thr、Asn、Gln、Tyr、Cys;2)带正电:His、Lys、Arg;3)带负电:Asp、Glu(2)非极性氨基酸:Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Phe、Met、Pro、Trp(三)氨基酸的重要理化性质一般物理性质无色晶体

4、,熔点极高(200℃以上),不同味道;水中溶解度差别较大(极性和非极性),不溶于有机溶剂。两性解离和等电点氨基酸在水溶液中或在晶体状态时都以离子形式存在,在同一个氨基酸分子上带有能放出质子的—NH3+正离子和能接受质子的—COO-负离子,为两性电解质。3.化学性质(1)与茚三酮的反应:Pro产生黄色物质,其它为蓝紫色。在570nm(蓝紫色)或440nm(黄色)定量测定(几μg)。调节氨基酸溶液的pH,使氨基酸分子上的—+NH3基和—COO-基的解离程度完全相等时,即所带净电荷为零,此时氨基酸所处溶液的pH值称为该氨基酸的等电点(pI)。H3N—CH—

5、COOHR+在酸性溶液中的氨基酸(pH<pI)H3N—CH—COO-R+在晶体状态或水溶液中的氨基酸(pH=pI)H2N—CH—COO-R在碱性溶液中的氨基酸(pH>pI)(当氨基酸相互连接成蛋白质时,只有其侧链基团和末端的α-氨基,α-羧基是可以离子化的。氨基酸等电点的确定:1)酸碱滴定(滴定曲线)2)根据pK值(该基团在此pH一半解离)计算:等电点等于两性离子两侧pK值的算术平均数。pI=————pK1+pK22or(pI=————)pK2+pK32(2)与甲醛的反应:氨基酸的甲醛滴定法R—CH—COO-NH3+R—CH—COO-NH2+H+OH

6、-中和滴定HCHOR—CH—COO-NHCH2OHHCHOR—CH—COO-N(CH2OH)2(3)与2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应NO2FO2N+HN—CH—COOHRNO2O2NHN—CH—COOHR+HF弱碱性DNP-氨基酸H2N—CH—COOH+RNCH3CH3O=S=OCl5-二甲氨基萘磺酰氯(DNS-Cl)pH9.740℃NCH3CH3O=S=OHN—CH—COOHRDNS-氨基酸取代DNFB测定蛋白质N端氨基酸,灵敏度高(4)与异硫氰酸苯酯(PITC)的反应—N=C=S+N—CH—COOHHHRPITC—N—C—N—CH—COOH

7、HHRSPTC-氨基酸—N—CHRSNCCOPTH-氨基酸pH8.3无水HF重复测定多肽链N端氨基酸排列顺序,设计出“多肽顺序自动分析仪”(5)与荧光胺反应:根据荧光强度测定氨基酸含量(ng级)。激发波长λx=390nm,发射波长λm=475nm。(6)与5,5′-双硫基-双(2-硝基苯甲酸)反应:H2N—CHCH2SSHNO2HOOCSNO2COOHCOOH+SSNO2NO2HOOCCOOHH2N—CH—COOH+CH2SHpH8.0硫代硝基苯甲酸测定Cys含量(pH8.0λ412nm的摩尔消光系数ε=13600)四、肽——一个氨基酸的α-羧基和另

8、一个氨基酸的α-氨基脱水缩合而成的化合物。氨基酸之间脱水后形成的键称肽键(酰胺键)。当两个氨基酸通过肽键相互

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