水体粪便污染的线粒体DNA溯源研究-论文.pdf

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1、南京大学学报(自然科学)第50卷第4期VolI50,NO.4JOURNAIOFNANJINGUNIVERSITY2014年7月July,2014(NATURALSCIENCES)DOI:10.13232/j.cnki.jnju.2014.04.002MitochondrialDNAsourcetrackingofwaterfecalcontaminationHeXiwei。MiaoYu,ChenHuimei,ZhangXuxiang(1.StateKeyLaboratoryofPollutionControlandResourceReuse,S

2、chooloftheEnvironment,NanjingUniversityNanjing210023,China;2.MedicalSchool,NanjingUniversity,Nanjing210093,China)Abstract:Waterenvironmentisoftencontaminatedbyhumanandanimalfecescontainingnutrientsincludingcarbon,nitr0genandphosphorus,aswellasvirulentpathogens.Correctandrapi

3、didentificationofthepollutionsourcesisconsideredcrucialtomitigatetheinfluenceofsuchcontamination.MitochondrialDNA,comingdirectlyfromahostce1l,isconsideredasanexcellentgeneticmarkerforfecalsourcetracking(FST)duetoitshighhostspecHicityanddetectionsensitivity.Thispapersummarize

4、stheadvancesandapplicationsofmitochondrialDNAsourcetrackingbasedoncomparisonswithmicrobialsourcetracking,highlightingthepotentialsandlimitationsofmitochondrialDNAsourcetracking.Asanewmethod,mitochondrialDNAsourcetrackinghastobeimprovedbasedonmorethoroughresearchesbeforeitisu

5、sedforroutinewateranalysisinthefuture.Keywords:fecalsourcetracking(FST),mitochondrialDNAsourcetracking,microbialsourcetracking(MST),polymerasechainreaction(PCR),nested—PCR,quantitativePCR(q—PCR),microarray,geneticmarker水体粪便污染的线粒体DNA溯源研究何席伟,苗雨,陈慧梅,张徐祥(1.污染控制与资源化研究国家重点实验室,南京大学

6、环境学院,南京,210023;2.南京大学医学院,南京,210093)摘要:畜禽粪便和生活污水是造成水体污染的主要因素之一.快速、准确地确定污染源对于水体污染防治尤为重要.近年来,基于线粒体DNA(mtDNA)Na)~特异性的污染物溯源技术已成为国际研究热点.本文综述了水体粪便污染的mtDNA溯源技术的理论基础及其应用进展,并通过与微生物溯源技术进行比较,分析了mtDNA作为溯源标记物的优势以及存在的问题,从而为实际环境水体中粪便污染的生物溯源工作提供参考.关键词:粪便污染溯源,线粒体DNA溯源,微生物溯源,聚合酶链式反应,巢式PCR,定量PC

7、R,基因芯片MajorScienceandTechnologyProgramofChinaforWaterPollutionControlandTreatment(2012ZX07101—002—004.2012ZX07506—004—004),EnvironmentalProtectionResearchProjectofJiangsuProvince,China(2012044,2O12045)*CorrespondingAuthor,Email:chenhuimei@nju.edu.Crl;zhangxx@nju.edu.cn第4期Hex

8、iwei~etaz.:Mit。ch。ndrialDNAs。urcetrackingofwaterfecalc。ntaminati。n‘389-libr

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