石斛属植物rDNA ITS序列的克隆与分析-论文.pdf

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1、浙江农业学报ActaAgricuhuraeZhejiangensis，2014，26(3)：685-692http：／／www．zjnyxb．en金建峰，朱思眉，蒋明，等．石斛属植物rDNAITS序列的克隆与分析[J]．浙江农业学报，2014，26(3)：685-692．DOI：10．3969／j．issn．1004-1524．2014．03．26石斛属植物rDNAITS序列的克隆与分析金建峰，朱思眉，蒋明，林蒙蒙，黄笑梅，何美云(台州学院生命科学学院，浙江椒江318000)摘要：对24种石斛属植物的rD

2、NAITS序列进行克隆分析，以期为石斛属植物的分子鉴定和遗传多样性研究提供依据。以叶片基因组为模板，利用通用引物分别扩增24种石斛属植物的ITS序列，结果表明，ITS全长为634～646bp，其中，5．8S序列的长度十分保守，均为164bp；而ITS1和ITS2序列长度变异较大，分别为226～235bp和241～247bp。ITS1和ITS2序列具有丰富的变异位点，分别为176和166个；其中，信息位点分别为114和104个，发现了大量的转换、颠换和插入／缺失现象。而5．8S序列相对保守，有36个变异位点

3、，其中信息位点16个。本研究表明，利用ITS序列可将本研究中的24种石斛属植物完全区分，这24种石斛属植物的遗传距离为0．007～0．302，其中鼓槌石斛和粟斑鼓槌石斛的遗传距离最小，亲缘关系最为接近；而金耳石斛与短棒石斛的遗传距离最大，亲缘关系最远。关键词：石斛属；ITS序列；克隆；分子鉴定中图分类号：R282．5文献标志码：A文章编号：1004—1524(2014)03-0685-08CloningandanalysisofrDNAITSsequencesfromDendrobiumplantsJIN

4、Jian—feng，ZHUSi—mei，JIANGMing，LINMeng·meng，HUANGXiao-mei，HEMei-yun(CollegeofLifeScience，Ta&houUniversity，Jiaojiang318000，China)Abstract：Inthepresentstudy，ITSsequenceswereclonedfrom24Dendrobiumplants，andwereanalyzedbybioinformatiessoftwaretoprovideevidence

5、sformolecularidentificationandgeneticdiversitystudy．ThefullITSsequencesof24plantsrangedfrom634—646bpinlength．Sequencesof5．8Swereconservedwiththesamelengthof164bp，whileITS1andITS2weremorevariablewithlengthsof226—235bpand24t一247bp，respectively．Variablesites

6、wererichinITS1andITS2sequences，astherewere176and166variablesiteswith114and104parsimonyinformationsites，respectively，andmanytransitions，transversions，anddeletions／insertionswereobserved．However，5．8Ssequencesweremoreconserved，andtherewere36variablesitesand1

7、6parsimonyinformationsites．ItwasshownthatITSsequencescouldbeusedtodistinguishall24Dendrobiumplantsstudiedhere．Thegeneticdistanceof24Dendrobiumplantsrangedfrom0．007to0．302．ThesmallestgeneticdistancewasobservedbetweenD．chrysotoxumandD．chrysotoxumvar．suaviss

8、imumrevealingtheirclosestrelationship，whilethelargestgeneticdistancewasdeterminedbetweenD．hookerianumandD．capillipesuncoveringtheirdistinctrelationship．Keywords：Dendrobium；ITSsequence；cloning；molecularidentification