ITS基因序列分析在鉴定暗色真菌中的应用-论文.pdf

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1、实用医学杂志2014年第3O卷第15期·检验与临床·ITS基因序列分析在鉴定暗色真菌中的应用张伟铮肖倩屈平华邓光远李松陈荼摘要目的:探讨使用ITS基因序列分析对浅部真菌病中分离的15株暗色真茵进行分子生物学鉴定,以了解致病菌株种类及指导临床治疗。方法:对浅部真菌病中分离的暗色真菌采用形态学方法观察茵落形态及显微镜下特征,并基于ITS序列对其进行PCR鉴定。结果:经形态学鉴定为15株暗色真菌的PCR产物经l%琼脂糖凝胶电泳分析.Tanon.3500凝胶成像系统鉴定扩增所得条带在500~700bp之间,测序结果经Blast比对,其中鉴定为链格孢2株,球孢枝孢酶2株,皮炎外

2、瓶霉2株,枝状枝孢霉、新月弯孢霉、微皱篮状茵、Phaeobotryoncupressi、极细枝孢霉、裴氏着色真茵、威尼克外瓶霉、Exophialaoligosperma、Fonsecaeamonophora各一株。结论:ITS基因序列分析可有效地鉴定暗色真菌,避免了由于临床经验不足而导致的漏检和误诊。关键词暗色真菌:ITS基因序列:PCR技术UseITSgenesequenceanaly~st0identifydemafiaceousfungiZHANGWei—zheng,XIA0Qiau,QuPing-hua,DENGCuang-yuan,LISong,CHENCh

3、a.DepartmentofLaboratoryMedicine,TheTraditionChineseHospitalofGuaugdongProvince,Guangzhou510006,ChinaCorrespondingauthor:CHENChaE—mail:cheneha906@163.con【Abstract】ObjectivesUseITSgenesequenceanalysistoidentify15strainsofdematiaceousfungi,tolearnthetypesofpathogenicstrainsandclinicaltrea

4、tment.MethodsByobservingthecolonymorphologyandmicroscopemorphologicalofthedematiaceousfungiisolatedfromsuperficialmycoses,andidentifiedbyITSgenesequenceanalysis.Results15strainswereidentifiedbymorphologicalobservationasdematiaceousfungi.TheamplifiedbandswereidentifiedbyTanon一3500gelimag

5、ingsystembetween500~700bp.Blastsequencingresultsshowthat2strainsAhemariaalternate,2strainsCladosporiumsphaerospermum.2strainsExophialadermatitis,1strainsCladosporiumcladosporioides,Curvularialunata,Talaromycesrugulosus,Phaeobotryoncupressi,Cladosporiumtenuissimum,Fonseceeapedrosoi,Exoph

6、ialawemeckii,ExophialaoligospermaandFonsecaeamonophora.ConclusionITSgenesequenceanalysiscanidenti~dematiaceousfungieffectively,avoidedundetectedandmisdiagnosecausebythelackofclinicalexperience.【Keywords】Dematiaceousfungi;ITSgenesequence;PCR暗色真菌(dematiaceousfungi)是一组孢子和手,且其对常用抗真菌药不敏感,危害严

7、重,发菌丝的壁具有黑色素样颜色的真菌.是广泛存在病率逐渐增高,已引起医学界的重视和关注。于自然界的腐生寄生生物,主要寄生于朽木、枯本研究利用ITS基因序列分析方法对我院近期草等腐败植物及土壤中,一般不引起人类感染。分离的l5株暗色真菌进行分子鉴定,现报告如当人类皮肤破损或免疫功能低下时.可导致人体下。皮肤组织和内脏器官深部真菌感染。皮肤感染来1资料与方法源于外伤种植,绝大多数患者为免疫健全者⋯。1.1一般资料对15例临床诊断为浅部真菌病该菌种类繁多,并且部分菌种形态差异不大。对且真菌直接镜检阳性者,进一步进行真菌培养及其培养鉴定需要扎实的理论基础和丰

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