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《系统发育研究中“长枝吸引”现象概述》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、HEREDITAS(Beijing)2007年6月,29(6):659―667ISSN0253-9772www.chinagene.cn综述DOI:10.1360/yc-007-0659系统发育研究中“长枝吸引”假象概述1,21,22,1黎一苇,于黎,张亚平1.云南大学生物资源保护与利用重点实验室,昆明650091;2.中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化实验室，昆明650023摘要:系统发育研究(phylogeny)不仅有助于重建地球所有生物体的进化历史,而且还可以揭示进化生物学领域中的一些基本问题。清晰了解各生物物种进化历程及不同物种之间的进化关系,是进
2、一步研究和探索生物学其他学科的基础。但是现今广泛应用的所有系统发育分析方法都存在一定的局限性,在一定程度上不能有效消除各种误差,从而不能客观地处理和分析数据,也就不能成功重建生物进化历程,真实反映物种进化关系。系统发育研究中,“长枝吸引”(Long-branchAttraction,LBA)假象是最为困扰研究者的问题。文章从“长枝吸引”问题的产生原由、检测方法以及消除策略等多个方面进行详尽概述,并通过列举典型实例,阐述了解决“长枝吸引”问题的途径。关键词:系统发育研究;长枝吸引;系统发育分析方法“Long-branchAttraction”artifactin
3、phylogeneticrecon-struction1,21,22,1LIYi-Wei,YULi,ZHANGYa-Ping1.LaboratoryofConservationandUtilizationofBio-resource,YunnanUniversity,Kunming650091,China;2.LaboratoryofMolecularEvolutioandGenomeDiversity,KunmingInstituteofZoology,theChineseAcademyofSciences,Kunming650023,ChinaAbstra
4、ct:Phylogeneticreconstructionamongvariousorganismsnotonlyhelpsunderstandtheirevolutionaryhistorybutalsorevealseveralfundamentalevolutionaryquestions.Understandingoftheevolutionaryrelationshipsamongorganismsestablishesthefoundationfortheinvestigationsofotherbiologicaldisciplines.Howe
5、ver,almostallthewidelyusedphy-logeneticmethodshavelimitationswhichfailtoeliminatesystematicerrorseffectively,preventingthereconstructionoftrueorganismalrelationships.“Long-branchAttraction”(LBA)artifactisoneofthemostdisturbingfactorsinphylogeneticreconstruction.Inthisreview,theconce
6、ptionandanalyticmethodaswellastheavoidancestrategyofLBAweresumma-rized.Inaddition,severaltypicalexampleswereprovided.TheapproachtoavoidandresolveLBAartifacthasbeendis-cussed.Keywords:phylogeneticreconstruction;Long-branchAttraction;phylogeneticmethods收稿日期:2006−12−26;修回日期:2007−02−09基
7、金项目:云南省科技厅项目和国家自然科学基金项目资助[SupportedbyScientificandTechnicalFundProjectofYunnanandChineseNationalNaturalScienceFoundation]作者简介:黎一苇(1981−),女,重庆人,硕士,专业方向:分子进化。E-mail:azalee_713@yahoo.com通讯作者:于黎(1976−),女,辽宁人,博士,研究员,研究方向:分子进化。Tel:0871-5033362,Fax:0871-5034838;E-mail:yuli1220@yahoo.com.cn
8、张亚平(1965−),男,云南人,博士
