长黄胡蜂属比较线粒体基因组学与系统发育研究

长黄胡蜂属比较线粒体基因组学与系统发育研究

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时间:2019-05-17

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1、分类号:Q95学校代码:10697:密级.公开学号:201520838i_NorthwestUniversty硕士字位论文’长黄胡因组学MASTER蜂属比较线粒体基长黄胡蜂属比较线粒体基因组学与系统发育研究学科名称:动物学作者:范旭蕾指导老师:谭江丽副教授西北大学学位评定委员会二〇一八年ComparativeMitochondrialGenomicsandPhylogenyofDolichovespulaAthesissubmittedtoNorthwestUnivers

2、ityinpartialfulfillmentoftherequirementsforthedegreeofMasterinZoologyByFanXuleiSupervisor:TanJiangliAssociateProfessor2018摘要摘要长黄胡蜂属Dolichovespula隶属于膜翅目Hymenoptera胡蜂科Vespidae胡蜂亚科Vespinae,是真社会性昆虫。长黄胡蜂属全世界已知20种,我国已知11种。长黄胡蜂属近似种之间的形态相似、同种之间体色存在差异,给形态学分类造成了困难,该类群系统发

3、育关系尚不清楚。Archer根据地理分布将该属分为6个种团。线粒体基因组为母系遗传,基因组成稳定且排列顺序保守。随着分子生物学技术的发展,尤其是近些年来高通量测序技术的发展和应用,线粒体基因组序列的获取更加方便快捷,被广泛应用于种群遗传学、生物地理学、近似种的鉴定和系统发育等研究。本论文完成了长黄胡蜂属5个代表种的线粒体基因组测序和数据分析,结合胡蜂科其他物种的线粒体基因组数据,利用13个蛋白编码基因构建了系统发育关系树,探讨了长黄胡蜂属内部及胡蜂科内部的系统发育关系。主要研究结果如下:(1)利用高通量测序技术首次测

4、定了长黄胡蜂属5个代表种的线粒体基因组序列。对线粒体基因组进行注释,分析了每个物种线粒体基因组的基因大小、基因组成、基因间隔区、排列顺序、碱基含量、密码子使用情况及tRNA的二级结构等。(2)开展了比较线粒体基因组学研究,对5个物种的线粒体基因组进行比较分析,发现长黄胡蜂属5个物种的A+T含量都在80%以上,而A+T富含区的长度存在差异。线粒体基因中,均有23个基因位于J链上,14个基因位于N链上。多数种类中atp8基因的A+T含量最高,cox1基因的A+T含量最低。基因重排热点区域相同,以tRNA基因为主,原位倒置

5、仅发生于喇嘛长黄胡蜂Dolichovespulalama的trnS1基因。其他重排事件如移位、洗牌和异位倒置在每个物种中均有发生。(3)基于13个蛋白编码基因的核苷酸序列和氨基酸序列,分别构建贝叶斯树和最大似然树,发现长黄胡蜂属系统发育关系为:熊猫长黄胡蜂Dolichovespulapanda与喇嘛长黄胡蜂Dolichovespulalama构成姐妹群,石长黄胡蜂Dolichovespulasaxonica与显长黄胡蜂Dolichovespulaxanthicincta构成姐妹群,上述类群又与花长黄胡蜂Dolicho

6、vespulaflora构成姐妹群;长黄胡蜂属、黄胡蜂属和胡蜂属间的系统发育关系为:(胡蜂属+黄胡蜂属)与长黄胡蜂属为姐妹群关系;胡蜂亚科、马蜂亚科和蜾蠃亚科间的系统发育关系为:(马蜂亚科+胡蜂亚科)与蜾蠃亚科为姐妹群关系。关键词:长黄胡蜂属,高通量测序,线粒体基因组,系统发育IABSTRACTABSTRACTThemembersofthegenusDolichovespula(Hymenoptera:Vespidae:Vespinae)areknowntoshowhighlydevelopedeusocialbeh

7、aviour.InChinaelevenspecieshavebeenfound,outofthetwentyspeciesofDolichovespulaknownworld-wide.TheclassificationofDolichovespulaandthestudyofthephylogeneticrelationshipsishamperedbythesimilarityofmorphologicalfeaturesandthelimitedresultsofmolecularresearch.Thege

8、nusDolichovespulawasdividedintosixspeciesgroupswiththeirdistributionsbyArcher.Thankstomolecularbiology,themitochondrialgenomesarewidelyusedinphylogeneticstudies;mitochondria

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