大豆高盐胁迫下根部组织酵母双杂交文库的构建与分析-论文.pdf

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1、上海农业学报2013,29(6):20—23ActaAgriculturaeShanghai文章编号:1000—3924(2013)06—020—04大豆高盐胁迫下根部组织酵母双杂交文库的构建与分析何晓兰,许玲,徐照龙,卫陪陪,刘晓庆,黄益洪,张大勇(江苏省农业生物学重点实验室,江苏省农业科学院农业生物技术研究所,南京210014;南京农业大学生命科学学院,南京210095)摘要:为了高效研究大豆耐非生物胁迫的分子调控网络,运用SMART(SwitchingMechanismat5’EndoftheRNATranscript)与DSN(Duplex—SpecificNul

2、ease)相结合的技术构建了栽培大豆高盐胁迫下根部组织的酵母双杂交cDNA文库。提取高质量的总RNA,利用Oligo(dT)引物反转录合成cDNA后,经DSN处理,然后利用Advantage2聚合酶进行长片段PCR扩增,电泳检测显示,产物均一,无高丰度条带,片段范围在0.75~5.[)(】kb;RT—PCR结果显示,GmActin基因在均一化后表达明显降低,表明均一化效果较好;最后通过SMART同源重组交换技术在酵母菌株Y187中构建了酵母双杂交所需的cDNA文库。文库质量检测结果表明:cDNA文库的总独立克隆数为5.61X10cfu、文库滴度为3.4X10cfu/mL、

3、重组率大于90%、插入片段长度为0.5~30kb,主要集中在1.0kb左右。关键词:大豆;根;酵母双杂交文库;耐盐性;互作蛋白中图分类号:$565.1;Q78文献标识码:AConstructionandanalysisofayeasttwo—hybrideDNAlibraryofsoybeanroottissueunderhighsaltstressHEXiao—lan,XULing,XUZhao-long,WEIPei-pei,LIUXiao-qing,HUANGYi-hong.ZHANGDa·yong(ProvincialKeyLaboratoryofAgrobiol

4、ogy,InstituteofBiotechnology,JiangsuAcademyofAgriculturalSciences,Nanjing210014,China;Collegeoflifescience,NanjingAgriculturalUniversity,Nanjing210095,China)Abstract:Inordertoelucidatethemolecularregulationnetworksforsoybeantolerancetoabioticstresses,ayeasttwo.hybridcDNAlibraryfromsoybean

5、roottissueunderhighsaltstresswasconstructedusingSMART(SwitchingMechanismat5’EndoftheRNATranscript)combinedwithDSN(Duplex-SpecificNulease)technique.Thehigh-qualitytotalRNAwasisolatedandsubjectedtoreversetranscriptionusingOligo(dT)16,andthedouble.strandcDNAsweresynthesizedandfurthertreatedw

6、ithDSN,thenlongfragmentPCRamplificationwasperformedusingAdvantage2polymerase,electrophoresisresultsshowedthatthebetterhomogeneousdegreeofPCRproductsrangedfrom0.75—5.O0kbinlengthandtheexpressionofGmActinsignificantlydecreasedbyRT—PCRafterhomogenization.Byusinghomologousrecombinationreactio

7、n,thedscDNAsweretransformedintotheY187yeastcompetentcellwiththelibraryplasmidpGADT7.Rec2toconstructtheyeasttwo.hybridcDNAlibrary.Detectionofthelibraryqualitydemonstratedthatitcontainedatotalof5.61x10。cfuindependentyeastclones,thecapacityofthelibrarywasupto3.4x10cfu/

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