ssr标记在杂交稻纯度鉴定中的应用

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1、上海农业学报2013，29(6)：53—55ActaAgriculturaeShanghai文章编号：1000．3924(2013)06—053—03SSR标记在杂交稻纯度鉴定中的应用张安宁，王加红，余新桥，刘国兰(上海市农业生物基因中心，上海201106)摘要：利用分布于水稻12条染色体上的600个SSR标记RM1～RM600对13个杂交组合的亲本进行了多态性分析，筛选出RM3、RM304和RM475组成的一组标记，在所有供试组合的亲本之间都可以检测到多态性，进而用这3个标记鉴定了13个组合杂交稻种子的纯度。关键词：杂交稻；种子鉴定；纯度检查；SS

2、R标记中图分类号：$511文献标识码：AApplicationofSSRmarkerstoseedpuritytestofhybridriceZHANGAn—ning，WANGJia-hong，YUXin·qiao，LIUGuo-lan(ShanghaiAgro60Z0gc＆ZGeneCenter，Shanghai201106，China)Abstract：The600SSRmarkersdistributingon12ricechromosomeswereusedtoanalyzethepolymorphismof13ricehybridizedc

3、ombinations’parents，andasetofmarkers-RM3，RM304，RM475-wereselected，bywhichthepolymorphismofallthetestcombinations’parentscouldbedetected．Further，theseedpuritiesofthe13combinationsweretestedbytheabove3markers．Keywords：Hybridrice；Seedidentification；Puritytest；SSRmarker杂交稻种子的生产质量取决

4、于组合亲本纯度与制种过程中人工去杂等各环节的质量。种子纯度鉴定是种子生产单位最关注的问题。种子纯度是衡量杂交稻种质量的重要指标，纯度不合格会对作物产量和质量产生影响，给农业生产带来损失，致使国家和农民的利益受到损害。低纯度的种子是良种推广、全国水稻总产提高的潜在障碍。以往对杂交水稻种子的真伪和纯度鉴定通常是在海南进行田间种植鉴定I1]，但田问种植鉴定周期长，鉴定费用高，难以满足经营及生产的需要。随着生物技术的不断发展，应用分子标记技术进行杂交稻真实性和纯度鉴定已逐渐成为越来越多的杂交稻育种单位的选择。DNA分子标记反映了DNA水平上生物个体间的遗传差

5、异，具有数量丰富、多态性高、不受环境影响、检测快速等优点而逐渐得到应用_3“]。由于SSR标记在单个座位上检测到的多态性远高于其他几种分子标记，且广泛、随机、均匀地分布于整个基因组，具共显性遗传等特点，能准确高效地鉴别大量等位基因，因此成为品种鉴定的理想分子标记j。经多家科研单位和学者的努力，SSR分子标记技术在杂交水稻种子纯度鉴定中已小范围应用于种子纯度检测实践。彭锁堂等[6选用分布于水稻12条染色体上的26对引物对9个杂交稻组合及其亲本进行了SSR分析，能够有效地区分所有的恢复系和大部分不育系，并对杂交稻组合‘汕优63’和‘两优培九’进行了单粒种

6、子SSR鉴定，所测纯度与田间种植鉴定纯度非常接近，认为SSR标记适合于杂交水稻种子纯度鉴定。辛业芸等_7应用SSR分子标记技术对5个超级杂交稻组合及其9个亲本进行了鉴定，找到在杂交稻组合及其亲本间具有多态性的引物，筛选出5对引物分别作为鉴定上述5个超级杂交稻组合的特异引物。收稿日期：2012—08—15基金项目：上海市科技兴农重点攻关项目[沪农科攻字(2010)第1-1号]；上海市青年科技启明星计划项目(11QA1405900)；国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2012AA101102)资助作者简介：张安宁(i983一)，男，硕士，助理研究

7、员，主要从事水稻育种研究。E·mail：zan@sagc．org．ca*通讯作者，Tel：(021)52230526；Email：lgl@sagc．org．cn54张安宁，等：SSR标记在杂交稻纯度鉴定中的应用本研究应用SSR标记技术对上海市农业生物基因中心的苗头组合及其亲本进行了多态性检测，快速鉴定组合纯度，为杂交水稻纯度简便、高效、快速鉴定提供依据。1材料与方法1．1水稻材料供试材料为上海市农业生物基因中心2010年度小制种的13个三系杂交稻组合(‘沪旱5A’／‘旱恢3号，、‘沪旱5A'／‘旱恢31号，、‘沪旱新1A，／‘旱恢3号’、‘沪旱7A’

8、／‘旱恢3号’、‘沪旱7A’／‘旱恢9号’、‘沪旱7A，／‘旱恢21号，、‘沪旱7A’／‘旱恢31号’、‘沪