25个油棕ssr标记的开发及应用这些标记评估油棕资源的遗传多样性

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1、江西农业学报2013，25(12)：27～31ActaAgricuhuraeJiangxi25个油棕SSR标记的开发及应用这些标记评估油棕资源的遗传多样性肖勇，杨耀东h，夏薇，沈雁，雷新涛，马子龙(1．中国热带农业科学院椰子研究所／海南省热带油料作物生物学重点实验室，海南文昌571339；2．中国热带农业科学院热带生物技术研究所，海南海口571101)摘要：应用NCBI网站上公布的EST序列，挖掘SSR位点，并根据SSR位点的侧翼序列设计引物，对18份油棕资源的DNA进行了PCR扩增，扩增结果显示，在72对引物的

2、PCR扩增中，25对引物具有多态性特征，并且其杂合度在0．1049和0．6605之间，平均杂合度为0．4702，这暗示了这些标记具有中度的多样性。同时，应用这些有多态性的标记评估了这些油棕资源的遗传多样性和群体结构，分析结构显示：椰子研究所油棕资源圃的遗传多样性最为丰富，此外，聚类分析表明不同位置来源的油棕资源展现了显著的遗传差异。本研究开发的SSR标记将能被应用到油棕的遗传育种研究中。关键词：油棕；SSR；杂合度；遗传多样性；群体结构中图分类号：$565．9文献标志码：A文章编号：1001—8581(2013)

3、12—0027—05Developmentof25SSRMarkersandTheirUsesinEvaluatingGeneticDiversityofOilPalmGermplasmResourcesXIA0Yong，YANGYao—dong，XIAWei，SHENYan，LEIXin—tao，MAZi—long(1．CoconutResearchInstitute，ChineseAcademyofTropicalAgriculturalSciences／HainanProvincialKeyLaborato

4、ryofTrop—icalOilCropsBiology，Wenchang571339，China；2．InstituteofTropicalBioscienceandBiotechnology，ChineseAcademyofTropicalAgriculturalSciences，Haikou571101，China)Abstract：TheresearchminedSSRlociaccordingtoESTsequencespublishedinNCB1website，anddesignedprimersb

5、asedonthesequencesflankingtheseSSRloci．Then，PCRamplificationoftheDNAsfrom18oilpalmgermplasmresourceswasea~iedouttotesttheirdiversity．Theamplificationresultsshowedthat：amongthePCRamplificationwith72pairsofprimers，thatwith25pairsofprimersobtainedpolymorphicband

6、s，andtheirheterozygosityvariedfrom0．1049to0．6605，withtheaverageof0．4702，indicatingthesemarkershadanintermediatelevelofgeneticvariance．Meanwhile，thesepolymorphicSSRmarkerswereusedtoe—valuatethegeneticdiversityandpopulationstructureoftheseoilpalmgermplasmresour

7、ces．TheresultsshowedthattheoilpalmgermplasmresourcesfromCoconutResearchInstitutehadtherichestgeneticdiversity．Clusteringanalysisdemonstratedthattherewasasignificantgeneticdiflerenceamongtheseoilpalmresourcesfromdifferentregions．ThedevelopedSSRmarkersinthisre—

8、searchwillhaveanimmediateapplicationinthegeneticbreedingofoilpalm．Keywords：Oilpalm；SSR；Heterozygosity；Geneticdiversity；Populationstructure油棕是一种木本热带油料作物，因产油量高而被代或者两代人的共同努力。因而如何提高油棕的育种称为“世界