扁豆过敏原LenC3蛋白B细胞抗原表位预测及同源建模-论文.pdf

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1、现代生物医学进展www．shengwuyixue．comProgressinModemBiomedicineVoL14NO．6FEB．2014．1017．DOI：10．13241／j．cnki．pmb．2014．06．005扁豆过敏原LenC3蛋白B细胞抗原表位预测及同源建模水郭予和何颖邹泽红刘雪婷许晨霞陶爱林△(广州市过敏反应与临床免疫重点实验室／呼吸疾病国家重点实验室变态反应研究室／广州医学院第二附属医院广东广州510260)摘要目的：通过应用生物信息学软件模拟、分析预测扁豆过敏原LenC3蛋白的结构、性质及B细胞抗原表位，为探索基于扁

2、豆过敏原Lenc3抗原表位的改造提供依据。方法：从Uniprot蛋白质数据库中得到扁豆过敏原LenC3的氨基酸序列，通过生物信息学软件Swiss．Model及Swiss—PdbViewer4．0模拟和分析扁豆过敏原LenC3蛋白的结构，使用DNAStar软件对其B细胞抗原表位进行模拟、分析预测。结果：扁豆过敏原LenC3蛋白为疏水性蛋白，在氨基酸残基第7-26位有一跨膜区，Ramachandran图评估扁豆过敏原LenC3蛋白的三维结构显示其空间构象稳定，LenC3蛋白潜在的B细胞抗原表位为35-36，48—50，66—71，87—90。结

3、论：本研究通过对扁豆过敏原LenC3蛋白进行生物信息学分析获得了该过敏原的结构、性质及潜在的B细胞抗原表位，为进一步了解和掌握扁豆过敏原LenC3蛋白的结构功能以及抗原性改造、单克隆抗体制备、表位疫苗设计等提供重要的线索。关键词：扁豆过敏原；LenC3；结构；抗原表位中图分类号：R392．8文献标识码：A文章编号：1673—6273(2014)06—1017—05PredictionoftheBCellAntigenicEpitopesandHomologyModelingStudyofLentilAllergenLenC3术GUOYu-h

4、e,HEYing,ZOUZe-hong,LIUXue—ting,XUChen-xia,TAOAi-liu(GuangzhouMunicipalKeyLaboratoryofAllergy&ClinicalImmunity,AllergyResearchBranchoftheStateKeyLaboratoryofRespiratoryDisease,theSecondAffiliatedHospitalofGuangzhouMedicalUniversity,Guangzhou,Guangdong,510260,China)ABSTRACT

5、Objective：Topredictandanalyzethestructure，biologicalcharacteristicsandBcellantigenicepitopesoflentilaller—genLenC3byusingbioinformaticssoftware，SOastoprovidecluesformodifyingtheantigenicepitopesoflentilallergenLenC3．Methods：TheaminosequenceoflentilallergenLenC3wasacquiredf

6、romUniprotproteindatabase．ThestructureoflentilallergenL-enC3wassimulatedandanalyzedbythebioinformaticssoftwareSwiss．ModelandSwiss．PdbViewer4．0，andtheBcellantigenicepitopesoflentilallergenLenC3werepredictedandanalyzedbyusingDNAStar．Results：LentilallergenLenC3withatransmembr

7、anedomainbelongstoahydrophobicprotein．TheRamachandranplotshowedthespatialconformationofLentilallergenLenC3wasstable．ThepotentialBcellantigenicepitopesofLenC3wereattheregionof35—36，48—50，66—71，87—90．Conclusion：Thisstudypredictedandanalyzedthestructure，biologicalcharacterist

8、icsandpotentialBcellantigenicepitopesoflentilallergenLenc3，whichprovidedimportantcluesfor