蛋白质-1 [兼容模式].pdf

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1、肽----蛋白质的一级结构氨基酸通过肽键聚合形成蛋白质的结构骨架一、肽的特征二、天然存在的活性肽三、蛋白质序列分析四、肽合成的方式蛋白质的结构层次一、肽键的特征L-α-氨基酸通过肽键连接形成肽（Peptide）a－肽键Ser-Gly-Tyr-Ala-Leu氨基酸残基(aminoacidresidue):肽链中的每个氨基酸。残基指一个氨基酸成肽失去HO后的部分。2肽单位20世纪30年代后期，LinusPaulin和RobertCorey用X-射线衍射法分析氨基酸和肽的精确结构，并预测蛋白质的构象，重要发现之一是确定了肽单位。肽单位(peptidegroup):是多肽链中从一个α-碳

2、原子到相邻α-碳原子之间的结构。肽单位的构象具有三个显著的特征。肽单位的三个显著特征：1．肽单位是一个刚性的平面结构肽键中羰基碳原子与氮原子之间所形成的键不能自由旋转，这个C-N键长=0132nm0.132nm一般C-N单键=0.147nm一般C=N双键=0.127nm所以具有部分双键(40%)性质，不能自由旋转，这使得肽单位所包含的六个原子处于同一个平面上，这个平面又称为酰胺平面（amideplane）或肽平面（peptideplane）。肽单位的六个原子处于同一平面2．肽平面中羰肽平面中羰氧基氧与与氨氢亚氨基氢大多大多处于相反位位置理论:顺式和反式实际:反式原因:相邻两个α-

3、碳上的侧链基团间立体干扰Pro羰基氧与亚氨基氢大多处于相反位置(Pro除外)3．Cα和-NH的N、Cα和-CO的Co之间是单键，可自由旋转C-N键旋转的角度为phi(φ)。αC-C键旋转的角度为psi(ψ)。αoΨ和Φ所在的平面称为C原子的二α面角(dihedralangle)或肽单位二面角。其理论上可在0～180°内变动，但R基团的限制，使Ψ和Φ的变动不是随意的。Gly受的限制最小，Pro受的限制最大。若两个肽链侧面相连，Cα在同一平面，此时Ψ和Φ必定为0。这种蛋白质构象是不存在的，因为α-COOH的O和α-NH的H立体重了.2肽的分类:二肽(Dipeptides):由2

4、个氨基酸缩合形成的肽。寡肽(oligopeptide):12~20个氨基酸残基的肽链。多肽(polypeptide):20~50个氨基酸残基的肽。蛋白质(protein)：50个以上氨基酸组成。氨基酸的平均相对分子量为110？20种AA平均分子量≈138蛋白质中多为小氨基酸,平均分子量≈128形成1个肽健去除1HO分子量=182AA平均分子量≈128-18=110。一般蛋白质含有50～2000个氨基酸。故分子量为5500～220000。各种蛋白质的分子量大小不一细胞色素c肌红蛋白血红蛋白胰岛素细胞色素c核酶溶解酵素肌红蛋白血红蛋白免疫球蛋白谷氨酸合成酶各种蛋白质的大小牛细胞色素C

5、牛胰凝乳蛋白酶原牛细胞色素C和牛胰凝乳蛋白酶原的多肽链各有其特定的氨基酸组成肽的书写：甘丙丝缬亮蛋赖赖精谷..Gly-Ala-Ser-Val-Leu-Met-Lys-Lys-Arg-Glu…G-A-S-V-L-M-K-K-R-E…肽的化学性质与氨基酸相似，但因α-氨基和α-羧基已经缩合，所以各氨基酸残基的R侧链对肽的性质的影响就更加突出。另外，肽的呈色反应也和氨基酸相似。在讨论单个多肽链时，蛋白质和多肽这两个术语可以互换。蛋白质(protein):广泛的定义是含有一条或多条肽链。单体蛋白(monomericprotein):只含一条多肽链。多聚体蛋白(multimericprot

6、ein):含一条以上的多肽链。同型多聚体(homomultimeric):蛋白中只含一种多肽链。异型多聚体(heteromultimeric):蛋白中含不同的多肽链。同型二聚体(homodimer):两条相同的多肽链亚基(subunits)组成的二聚体。异型二聚体(heterodimer):两条不同的多肽链亚基(subunits)组成的二聚体。二、天然存在的活性肽活性肽(activepeptide)：存在于生物体内，具各种特殊生物学功能的肽。GSH（谷胱甘肽）——医学上重要的肽CysGlyGluγ-肽键GSH分子中有一个特殊的γ-肽键，是由谷氨酸的γ-羧基与半胱氨酸的α-氨基缩

7、合而成的，这与蛋白质分子中的α－肽键不同。谷胱甘肽还原酶GSH功能：解毒功能：SH基团可和致癌剂、药物结合，避免体内RNA、DNA和蛋白质受损。还原剂：维持红细胞膜的完整性。参与许多蛋白质和多肽的二硫键的形成。参与维生素的代谢过程。是一些酶发挥作用所必需的辅助因子。GSH上的H，在谷光甘肽过氧化酶的催化下，能还原细胞内产生的HO，使其变为HO。222短杆菌肽S有些肽链是环状结构，没有游离的羧基端和氨基端。如毒蘑菇中存在的α-鵝膏蕈碱是一个环状8肽，它能抑制真核RNA