药物分子胎盘屏障渗透的支持向量回归模型.pdf

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1、第23卷第7期化学研究与应用V01．23．No．72011年7月ChemicalResearchandApplicationJuly，2011文章编号：1004—1656(2011)07-0872-05药物分子胎盘屏障渗透的支持向量回归模型李伟，周建平，杨胜勇(四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室，四川成都610041)摘要：药物分子透过胎盘屏障进入胎儿体内可能对胎儿造成不良影响，在临床及药物研发中评估药物分子的胎盘屏障渗透能力，对于保护受孕期的妇女以及胎儿，都有着十分重要的作用。本文使用了组合的遗传算法．共轭梯度-支持向量回归(GA

2、—CG-SVR)方法，建立了一个药物分子胎盘屏障渗透的预测模型。对于所建模型，使用5重交叉验证和独立测试集方法进行了验证，预测值和实验值的相关系数分别达到0．82和0．77。我们也讨论了描述符选择和参数优化对SVR模型预测精度的影响，并将GA—CG-SVR模型与常用的多重线性回归(MLR)模型和K最邻近节点法(KNN)模型进行了比较，结果表明，GA—CG．SVR模型的预测精度明显优于其他方法建立的模型。关键词：胎盘屏障；支持向量回归；描述符选择；参数优化中图分类号：0641．121文献标志码：A文献标识码：AApredictionmod

3、elofplacentabarrierpenetrationofdrugmoleculesbasedonsupportvectorregressionLIWei，ZHOUJian-ping，YANGSheng-yong’(StateKeyLaboratoryofBiotherapy，WestChinaHospital，SichuanUniversity，Chengdu610041，China)Abstract：ManydrugmoleculescantransferfromthemothertoherfetusacrOSStheplac

4、entabarrier，whichmayleadtotoxicefectstothefetus．Soitisimportanttoevaluatetheplacentabarrierpenetrationofdrugmoleculesforprotectingthemotherandthefetus．Inthisinvestigation，weadoptallsupportvectorregression(SVR)combinedwithgeneticalgorithm(GA)andconjugategradient(CG)method

5、(GA—CG-SVR)tobuildapredictionmodelofplacentabarrierpenetrationofdrugmolecules．Five-fold—CROSS—validationmethodandanindependentevaluationsetmethodwereusedtotesttheSVRmodel，whichresultsshowthatthecorrelationcoefficientsofthepredictedValuesbythedevelopedmodelandexperimental

6、ValUeSofthetrainingsetsandthetestsetsare0．82and0．77，respectively．WealsodiscusstheinfluenceofthedescriptorselectionandtheSVMparametersettingonthepredictionaccuracyofSVRmode1．Finaly，comparedwitllmodelsdevelopedbymulti-linearregression(MLR)andk-nearestneighbor(KNN)methods，t

7、hemodelofplacentabarrierpenetrationofdrugmoleculesbuiltbyGA-CG—SVRisobviouslybetterintermsofthepredic—tionaccuracy．Keywords：placentabarrier；supportvectorregression；descriptorselection；parameteroptimization胎盘屏障(placentabarrier)是存在于母体和源物质，例如药物分子等，进入胎儿体内对胎儿造胎儿之间的一道保护防线，它可防止

8、母体内的外成不良影响。然而并非所有药物都不能透过胎盘收稿日期：2011-03·17；修回日期：2011-04-13基金项目：国家自然科学基金项目(20872100)资助联系人简介：杨胜勇(1968·)男，教