解淀粉芽孢杆菌pyrR基因敲除载体的构建.pdf

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1、南方农业学报JournalofSouthernAgriculture2015.46(8):1339—1344ISSN2095—1191;CODENNNXAABhttp://www.nf.yxb.coinDOI:10.39696:issn.2095-1191.2015.08.1339解淀粉芽孢杆菌]pyrR基因敲除载体的构建吴庆,刘慧燕,方海田+,何建国,贺晓光,王梦娇,于丽男(宁夏大学农学院,银川750021)摘要:【目的】构建用于解淀粉芽孢杆菌(Bacillusamyloliquefaciens)py

2、rR基因敲除的温敏型敲除载体,为研究pyrR蛋白缺失对胞苷合成的影响奠定基础。【方法】设计并合成含有限制性内切酶酶切位点的引物,以解淀粉芽孢杆菌基因组DNA为模板,利用PCR分别扩增pyrg基因的上游同源序列和下游同源序列,再定向克隆至含卡那抗性基因的pKSl温敏型载体上,构建敲除载体pKSl-pyrR。【结果】经特异性引物对pyrR-S1/pyrR.A17fllpyrR.S2/pyrR.A2扩增,获得解淀粉芽孢杆菌目的DNA片段pyrR.up和pyrR.down,大小约500bp;目的片段经克隆载体p

3、MDl9.T连接、Transl.T1转化,获得的重组质粒分别以KpnI/HindIII、PstI/NotI双酶切鉴定和测序后,可获得大小约500bp的上、下游克隆载体T-pyrR.up和IT-pyrR.down。上游克隆载体T-pyrR.up经_KpnI与H/ridIII双酶切及T4DNA连接、Transl.T1转化后,进行重组载体检测和质粒双酶切鉴定,得到大小分别为433、5064bp的片段,与连接长度一致,构建获得带标记基因的重组载体pKSl-pyrR.up。采用PstI和NotI对T-pyrR.d

4、own和pKSl-pyrR.up同时进行双酶切,经连接、转化、双酶切鉴定后,得到两条长度分别为446和5497bp的片段,与连接前长度一致,证明pyrR的上、下游同源臂已正确插入到pKSl载体中,获得敲除载体pKSl-pyrR。【结论】构建的解淀粉芽孢杆]基pyrR基因敲除载体pKSl-pyrR可用于研究敲除pyrR基因及pyrR蛋白缺失对胞苷过量合成的影响。关键词:解淀粉芽孢杆菌;pyrR基因;基因敲除;温敏型敲除载体;胞苷中图分类号:Q786文献标志码:A文章编号:2095~1191(2015)08

5、—1339—06ConstructionofpyrRgeneknock-outvectorforBacillusamyloliquefacienswuQing,LIUHui-yan,FANGHai-tian+,HEJian-guo,HEXiao-guang,WANGMeng-jiao,YULi-nan(SchoolofAgriculture,NingxiaUniversity,Yinchuan750021,China)Abstract:【Objective】,I’}lepresentstudywasco

6、nductedtoconstructatemperature—sensitiveknock—outvectorforpyrRgeneinBatillusamyjoliquefaeiensinordertolaythefoundationforstudyingtheeffectsofeyrRproteindeftciencyoncyti—dinesynthesis.【Method】rrheprimerswithrestrictedendonucleaseslocusweredesignedfirsdy,f

7、ollowedbyamplifyingtheupstreamanddownstreamarms’sequencesofpyrRgeneinB.amyloliquefaciensbyusinggenomeDNAastemplateandPCRmethod.Then.theamplifiedfragmentswereclonedintothetemperaturesensitivevectorpKSltoconstructtempera-turesensitiveknock-outvectorpKSl-py

8、rRcontainingupstreamanddownstreamhomologoussequencesofpyrRgene,andkanamyeingene.【Result】TIleobtainedtargetfragmentsofpyrR-upandpyrR—downinB.amyloliquefacienswereabout500bpinlengthafteramplifiedwithspecificprimerpairpyrR-Sl

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