松墨天牛葡萄糖-6-磷酸异构酶基因克隆及序列分析.pdf

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1、南方农业学报JournalofSouthernAgriculture2016，47(5)：657—661ISSN2095—1191；CODENNNXAABhttp：／／www．．fny】【b．cornDOI：10．39690：issn．2095-1191．2016．05．657松墨天牛葡萄糖一6一磷酸异构酶基因克隆及序列分析蔡紫玲，陈敬祥，林同+(华南农业大学林学与风景园林学院。广州510642)摘要：【目的】克隆松墨天牛(Monochamusaltemtus)葡萄糖．6．磷酸异构酶(GPI)基因eDN

2、A序列，探究其分子特征，为深入研究松墨天牛GPI的分子功能打下基础。【方法】采用RACE技术克隆松墨天牛G雕基因eDNA序列，并对该序列及其编码氨基酸序列进行生物信息学分析。【结果】克隆并鉴定松墨天牛GPl基因，命名为MaGPl(GenBank登录号：KU323592)，该基因序列长1038bp，共编码279个氨基酸。同源比对分析发现，松墨天牛与赤拟谷盗(Triboliumcastaneum)的同源性最高，达90％，而与其他昆虫的同源性在76％以上。系统发育进化树分析结果表明，松墨天牛与赤拟谷盗在同一分

3、支，与家蚕(Bombyxmon)相隔最远。MaGPI为亲水蛋白，含有5个功能位点：活性位点、变构位点、活性部位盖子和两个多肽结合位点。【结论】明确了MaGPJ的核苷酸序列及编码蛋白特征，为进一步研究MaGPI的分子功能提供依据。关键词：松墨天牛；葡萄糖．6．磷酸异构酶；克隆；生物信息学中图分类号：Q966文献标志码：A文章编号：2095一119l(2016)05—0657_05Cloningandseqanalysisofglucose一6一phosphateandseuenceSOIosphate—O

4、一●l---··lsomerase卵neinM伽oclt舢吣alterat啷CAIZi-ling，CHENJing-xiang，LINTong+(CoHegeofForestryandLandscapeArchitecture，SouthChinaAgriculturalUniversity，Guangzhon510642，China)Abstract：【ObjectiveIThepresentexperimentwasconductedtoclonefull-lengtheDNAofglucose-6

5、-phosphateiso-merase(GPI)fromMonochamns{dteratus，andanalyzeitsmolecularcharacteristics，inorder10laythefoundationforfur-therstudyingitsfunctions．【Method]TheeDNAofGPIgeneWaSclonedfromM．MteratnsusingRACEtechnology．Thegenesequcenceanditsaminoacidsequencewere

6、analysedusingbioinformaticssofiwares．【Result]TheGPIgeneWaSclonedsuccessfullyfromM．alteratus，andnamedMaGPI(GenBankaccessionno．KU323592)．ItseDNAwas1038bpinlength．encoding279gnlinoacids．Thealignmentofaminoacidset]ueflcesshowedthat，MaGPIsharedthehi曲esthomolo

7、gy(90％)withGPIgeneofTriboliumcastaneum，andsharedhomologyof76％withotherinsects．Thephylogenefictreeshowedthat朋：ahemmsandZe丑s￡&舱拄mWasinthes副fflebranch．andfarfromBombyxmoff．MaGPlwasahydrophiheprotein，with5functionalsitesv／z．，activesite，allostericsite，capofac

8、tivesite，peptidebindingsite．【Conclusion]ThesequenceofnucleofideandcharacteristicsofanlinoacidsequenceencodedbyMaGPIgenehavebeenclarified，inordertoprovideafoundationforfurtherresearchingmolecularfunctionofMaGPI．Keywords：Mon