核酸电泳的双指示剂(溴酚兰和二甲苯青)与染色剂.doc

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时间:2020-03-18

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1、核酸电泳的双指示剂(溴酚兰和二甲苯青)与染色剂指示剂核酸电泳常用的指示剂有溴酚兰和二甲苯青。溴酚兰在碱性液体中,呈紫兰色,在0.6%、1%、1.4%和2%琼脂糖凝胶电泳中,溴酚兰的迁移率分别与1Kb、0.6Kb、0.2Kb和0.15Kb的双链线性DNA片段大致相同.二甲苯青的水溶液呈兰色,它在1%和1.4%琼脂糖中电泳时,其迁移速率分别与2Kb和1.6Kb的双链线性DNA大致相似。指示剂一般与蔗糖、甘油或聚蔗糖400组成载样缓冲液。载样缓冲液的作用有:①增加样品密度,使其比重增加,以确保DNA均匀沉入加样

2、孔内;②在电泳中形成肉眼可见的指示带,可预测核酸电泳的速度和位置;③使样品呈色,使加样操作更方便。琼脂糖电泳时往往在样品中同时加入这两种指示剂,溴酚蓝指示小片段DNA,二甲苯青指示大片段DNA。PS:二甲苯青FFC25H27N2O6S2NaFW:538.6 用于琼脂糖聚丙烯酰胺凝胶电泳的示踪染料,易溶于水和醇,带电荷数少,移动速度慢。染色剂核酸电泳后,需经染色后才能显现出带型,最常用的是溴化乙锭染色法,其次是银染色。溴化乙锭(ethidiumbromide,EB)是一种荧光染料,EB分子可嵌入核酸双链的碱

3、基对之间,在紫外线激发下,发出红色荧光。根据情况可在凝胶电泳液中加入终浓度为0.5ug/ml的EB,有时亦可在电泳后,将凝胶浸入该浓度的溶液中染色10~15min.琼脂糖凝胶EB染色,肉眼可见核酸电泳带,其DNA量一般>5ng,当溴化乙锭太多,凝胶染色过深,核酸电泳带看不清时,可将凝胶放入蒸馏水浸泡30min后再观察。注意:EB具有强致癌性,因此需要防止污染,避免皮肤接触,操作时要控制在划定的污染区,戴一次性塑料手套,废弃物妥善处理。  银染色液中的银离子(Ag+)可与核酸形成稳定的复合物,然后用还原剂如

4、甲醛使Ag+还原成银颗粒,可把核酸电泳带染色黑褐色,主要用于聚丙烯酰胺凝胶电泳染色,也用于琼脂糖凝胶染色,其灵敏度比EB高200倍.但银染色后,DNA不宜回收。

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