海洋天然产物hymenialdisine及其类似物与CDK5作用模式的研究【毕业设计】

《海洋天然产物hymenialdisine及其类似物与CDK5作用模式的研究【毕业设计】》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、本科毕业设计（20__届）海洋天然产物hymenialdisine及其类似物与CDK5作用模式的研究目录中英文摘要1引言11.1细胞周期蛋白依赖性激酶（cyclin-dependentkinases,CDKs）11.1.1细胞周期蛋白依赖性激酶5(cyclin-dependentkinase5,CDK5)11.2来自海洋的ATP竞争性抑制剂11.2.1海洋天然产物hymenialdisine(HMD)及其类似物11.3分子对接21.4定量构效关系（QSAR）21.4.1二维定量构效关系（2D-QSAR）21.4.2三维定量构效关系（3D-QSAR）22计算方法32.1化合物及活性数据的选择3

2、2.2分子对接82.33D-QSAR研究82.3.1分子三维结构的构建82.3.2分子叠合92.3.3COMFA模型建立92.3.4COMSIA模型建立103结果与讨论103.1分子对接模型103.2COMFA和COMSIA模型113.3COMFA和COMSIA模型的三维等势图144结论18参考文献19摘要:CDK5是神经系统中重要的蛋白激酶之一，是神经损伤和神经退行性病变的治疗靶点，可作为防治中枢神经系统疾病的靶分子。CDK抑制剂具有良好的ATP竞争性抑制活性，由于大多数激酶ATP结合位点的保守性，使激酶抑制剂缺乏较好的选择性，所以选择性一直是激酶抑制剂研究中的重要难题和研究热点。针对CD

3、K5受体抑制剂hymenialdisine及其类似物，本文采用分子对接、比较分子场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)进行化合物活性数据和三维结构参数之间关系的研究，构建了对接模型、CoMFA及CoMSIA模型。对接结果显示激酶抑制剂与CDK5的结合主要是通过氢键作用来实现的。CoMFA模型的交叉验证相关系数q2为0.518，非交叉验证相关系数r2为0.885；CoMSIA的q2和r2分别为0.507和0.928。两组模型均具有较好的预测能力，为激酶抑制剂的结构与活性和选择性的关系及优化改造提供了重要的理论依据和指导意义。关键词：CDK5；hymenialdisin

4、e；分子对接；CoMFA；CoMSIAAbstract:CDK5isanimportantproteinkinaseinthenervoussystem,andisanerveinjuryandneurodegenerativediseasetherapeutictarget,whichcanbeusedastargetmoleculesforpreventionandtreatmentofcentralnervoussystemdiseases.CDKinhibitorshaveagoodATPcompetitiveinhibitoryactivity.Sincetheconservati

5、oninmostkinaseATPbindingsiteleadstothelackofgoodselectivityofkinaseinhibitors.Theselectivityhasbeenanimportantresearchproblemandresearchfocusinkinaseinhibitors.ForCDK5receptorinhibitorshymenialdisineanditsanalogues,moleculardocking,CoMFAandCoMSIAwereusedtoresearchtherelationshipbetweencompoundactiv

6、itydataandthree-dimensionalstructureparameters.Docking,CoMFAandCoMSIAmodelswerebulit.DockingresultdisplayedthatthecombinationofkinaseinhibitorsandCDK5mainlyachievesbyhydrogenbonds.Theq2ofleave-one-outcrossvalidationinCoMFAmodelis0.518andr2ofthenovalidationinCoMFAis0.885.Theq2andr2ofCoMSIAmodelis0.5

7、07and0.928,respectively.Twomodelshavegoodpredictiveability,whichwillprovideimportanttheoreticalbasisandguidancefortherelationshipbetweenstructureandactivityandselectivityofkinaseinhibitors.Keywords:CDK5;hym